RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 KIR3DP1A8MWS1 328 aa23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM114B3SHH9 223 aa23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 LRATO95237 230 aa23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 CBX7O95931 251 aa23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 CCL3P10147 92 aa23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF24P17028 368 aa23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 MPIP34949 423 aa23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF628Q5EBL2 1059 aa23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF441Q8N8Z8 693 aa23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 C20orf27Q9GZN8 174 aa23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 LRRK2Q5S007 2527 aa23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 MYO1GB0I1T2 1018 aa23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 NME6O75414 186 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 P04436 131 aa23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 JUNP05412 331 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 FBXO45P0C2W1 286 aa23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 SDC1P18827 310 aa23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 CNR1P21554 472 aa23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 GPX3P22352 226 aa23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC1A6P48664 564 aa23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 STX3Q13277 289 aa23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 NNATQ16517 81 aa23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 IKBIPQ70UQ0 350 aa23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 SIAH3Q8IW03 269 aa23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 PRR22Q8IZ63 422 aa23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF781Q8N8C0 355 aa23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 GOLM1Q8NBJ4 401 aa23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 POGLUT1Q8NBL1 392 aa23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 OR2M7Q8NG81 312 aa23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 TP53INP1Q96A56 240 aa23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 FCRL1Q96LA6 429 aa23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 GPR137Q96N19 417 aa23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 SACM1LQ9NTJ5 587 aa23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 COL12A1Q99715 3063 aa23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 PIGAP37287 484 aa23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 DNASE1L1P49184 302 aa23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 WDR4P57081 412 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 PLGLB1Q02325 96 aa23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 CEBPEQ15744 281 aa23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 XKR7Q5GH72 579 aa23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC22A10Q63ZE4 541 aa23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM47EQ6ZV65 393 aa23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM9CQ8IZT9 166 aa23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 OR10G3Q8NGC4 313 aa23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF675Q8TD23 568 aa23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 TLCD1Q96CP7 247 aa23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 PPP1R36Q96LQ0 422 aa23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 PPP3R2Q96LZ3 170 aa23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 CCT7Q99832 543 aa23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 ITPAQ9BY32 194 aa23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 TAS2R7Q9NYW3 318 aa23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 CFL2Q9Y281 166 aa23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 TMED5Q9Y3A6 229 aa23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa23.05■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 TFECO14948 347 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNHIT1O43257 154 aa23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 ASNA1O43681 348 aa23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 HS6ST1O60243 411 aa23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 BCKDHAP12694 445 aa23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 GRK2P25098 689 aa23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 KRTCAP3Q53RY4 240 aa23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 C1orf50Q9BV19 199 aa23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 RAP2CQ9Y3L5 183 aa23.04■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 NTSP30990 170 aa23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 EMDP50402 254 aa23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 NRG3P56975 720 aa23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 FBXW4P57775 412 aa23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 HSF1Q00613 529 aa23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 BST1Q10588 318 aa23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 PRAMEF20Q5VT98 475 aa23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 C1QL3Q5VWW1 255 aa23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 OR7G2Q8NG99 324 aa23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 ARL8AQ96BM9 186 aa23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 TUBGCP3Q96CW5 907 aa23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 SORT1Q99523 831 aa23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM173AQ9BQD7 235 aa23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 GLIPR2Q9H4G4 154 aa23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 REEP4Q9H6H4 257 aa23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 SH3BP4Q9P0V3 963 aa23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 PRODH2Q9UF12 536 aa23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC5A6Q9Y289 635 aa23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 NINQ8N4C6 2090 aa23.03■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM166BA8MTA8 275 aa23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 CAPN14A8MX76 684 aa23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 LRRTM2O43300 516 aa23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 RPL14P50914 215 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 PPIAP62937 165 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 RBPJQ06330 500 aa23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 NTRK2Q16620 822 aa23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF385BQ569K4 471 aa23.02■■□□□ 1.28
HTATSF1-202ENST00000425695 C6orf136Q5SQH8 315 aa23.02■■□□□ 1.28
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