RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410466.1

RNU6-554P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 554, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-554P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-554P-201ENST00000410466 MYL6BP14649 208 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 GLRA1P23415 457 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 IGFBP5P24593 272 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 FHITP49789 147 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 KCTD2Q14681 263 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 PTGISQ16647 500 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 PIGGQ5H8A4 983 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 ZNF684Q5T5D7 378 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 SEL1L2Q5TEA6 688 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 METTL11BQ5VVY1 283 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 ACAD10Q6JQN1 1059 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 SPNS3Q6ZMD2 512 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 TIGD4Q8IY51 512 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 SPATA5Q8NB90 893 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 OR13C5Q8NGS8 318 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 TMEM159Q96B96 161 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 TM2D3Q9BRN9 247 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 CARD6Q9BX69 1037 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 HCAR1Q9BXC0 346 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 TEKT3Q9BXF9 490 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 ADGRL4Q9HBW9 690 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 ONECUT1Q9UBC0 465 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 CDH9Q9ULB4 789 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 A0A1B0GWB2 263 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 ZNF732B4DXR9 585 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 ADAMDEC1O15204 470 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 C17orf67Q0P5P2 114 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 GDPD3Q7L5L3 318 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 CPLX4Q7Z7G2 160 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 C9orf40Q8IXQ3 194 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 GPR148Q8TDV2 347 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 GIMAP1Q8WWP7 306 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 LPGAT1Q92604 370 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 FGGYQ96C11 551 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 CPNE1Q99829 537 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 C17orf62Q9BQA9 187 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 APOL6Q9BWW8 343 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 NACAP1Q9BZK3 213 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 IFI27L2Q9H2X8 130 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 PSD3Q9NYI0 1048 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 TMOD3Q9NYL9 352 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 TRAV18A0A075B6X5 111 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 ADAM12O43184 909 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 ECDO95905 644 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 IGKV1-39P01597 117 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 IGKV1D-39P04432 117 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 GLULP15104 373 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 PFKFB1P16118 471 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 APOC4P55056 127 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 RPL27P61353 136 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 RPL32P62910 135 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 DPYSQ14117 519 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 BRD3Q15059 726 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 RABGAP1LQ5R372 815 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 CXCL17Q6UXB2 119 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 ZSCAN30Q86W11 494 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 GVQW1Q8N7I0 195 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 MCUQ8NE86 351 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 OR1P1Q8NH06 330 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 OR4F5Q8NH21 305 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 RFESDQ8TAC1 157 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 SLC26A7Q8TE54 656 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 TCP11Q8WWU5 503 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 SLC35C1Q96A29 364 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 ZUFSPQ96AP4 578 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 C5orf30Q96GV9 206 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 CCDC136Q96JN2 1154 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 COQ7Q99807 217 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 ALG9Q9H6U8 611 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 NOX3Q9HBY0 568 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 SLC24A2Q9UI40 661 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 IFT52Q9Y366 437 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-554P-201ENST00000410466 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-554P-201ENST00000410466 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms