RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 ASPDHA6ND91 283 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 PDZK1P1A8MUH7 402 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 H0Y3Z8 333 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 NME4O00746 187 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 DFNA5O60443 496 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 PRAMEF4O60810 478 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 SDC3O75056 442 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 SEC22BO75396 215 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 AGFG2O95081 481 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 SFTPCP11686 197 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 PRF1P14222 555 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 SLC2A4P14672 509 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 AMD1P17707 334 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 DDX5P17844 614 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 PRPS1L1P21108 318 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 SLC6A2P23975 617 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.424e-7■■■■■ 30.5
CCL20-202ENST00000409189 HPCAL1P37235 193 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 RPL3P39023 403 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 VHLP40337 213 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 GSTM5P46439 218 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 RABIFP47224 123 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 NME5P56597 212 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 CLDN8P56748 225 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 UFM1P61960 85 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 ACSM2AQ08AH3 577 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 LRRC74AQ0VAA2 488 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 PTGR1Q14914 329 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 PDCD1Q15116 288 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 ISXQ2M1V0 245 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 VPS26BQ4G0F5 336 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 MTX3Q5HYI7 312 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 FAM219BQ5XKK7 198 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 ACSM2BQ68CK6 577 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 LCN8Q6JVE9 175 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 SUSD1Q6UWL2 747 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 GCNT7Q6ZNI0 430 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 IKBIPQ70UQ0 350 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 CAMKMTQ7Z624 323 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 C17orf64Q86WR6 236 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 PPFIBP2Q8ND30 876 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 TTLQ8NG68 377 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 OR7G3Q8NG95 312 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 OR52N2Q8NGI0 321 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 OR5AR1Q8NGP9 310 aa6.19□□□□□ -1.42
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CCL20-202ENST00000409189 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 LRRC58Q96CX6 371 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 PDXPQ96GD0 296 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 C12orf66Q96MD2 445 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 CCDC115Q96NT0 180 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 CDRT15Q96T59 188 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 SH3GL1Q99961 368 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 NT5DC2Q9H857 520 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 RMND5AQ9H871 391 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 S100A14Q9HCY8 104 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 FZD3Q9NPG1 666 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 VPS29Q9UBQ0 182 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 CD300AQ9UGN4 299 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 SUFUQ9UMX1 484 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 C15orf41Q9Y2V0 281 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 L3MBTL1Q9Y468 752 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.19□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa6.18□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 PRORSD1PA6NEY8 169 aa6.18□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 AQP12BA6NM10 295 aa6.18□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa6.18□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 ACOT8O14734 319 aa6.18□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 ERN1O75460 977 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 PRKD3O94806 890 aa6.18□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 ABHD16AO95870 558 aa6.18□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa6.18□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 BCKDHAP12694 445 aa6.18□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 ANPEPP15144 967 aa6.18□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 CD1EP15812 388 aa6.18□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 HRH2P25021 359 aa6.18□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 IL12AP29459 219 aa6.18□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
CCL20-202ENST00000409189 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
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