RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 SYT3Q9BQG1 590 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 POT1Q9NUX5 634 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 FAM86C1Q9NVL1 165 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 COPZ2Q9P299 210 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 A0A0D9SEW6 157 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 MAFKO60675 156 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 TRAPPC6AO75865 159 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 IL33O95760 270 aa8.47□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 LDLRAD1Q5T700 205 aa8.47□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 OR10T2Q8NGX3 314 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 PPP1R35Q8TAP8 253 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 G6PC3Q9BUM1 346 aa8.46□□□□□ -1.05
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