RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 A0A1W2PP55 124 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 CEACAM5P06731 702 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 CKMT1AP12532 417 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 DEFA1P59665 94 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 DEFA3P59666 94 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 PRR5P85299 388 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 GINS1Q14691 196 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 UAP1L1Q3KQV9 507 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 YAF2Q8IY57 180 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 CLIP4Q8N3C7 705 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 MORN4Q8NDC4 146 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 FLCNQ8NFG4 579 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 OR6T1Q8NGN1 323 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 ASPNQ9BXN1 380 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 GIMAP4Q9NUV9 329 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 QPCTLQ9NXS2 382 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 SERGEFQ9UGK8 458 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 CLEC2DQ9UHP7 191 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 STUB1Q9UNE7 303 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 SYT5O00445 386 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 EMC8O43402 210 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 MYOGP15173 224 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 ALOX12P18054 663 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 TIE1P35590 1138 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 GIPRP48546 466 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 CDK5Q00535 292 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 FUT5Q11128 374 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 DUSP6Q16828 381 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 IQCHQ86VS3 1027 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 GJD3Q8N144 294 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 OR2L3Q8NG85 312 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 CNPPD1Q9BV87 410 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 NDUFB11Q9NX14 153 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 ATG4BQ9Y4P1 393 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 IRGMA1A4Y4 181 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 GLOD5A6NK44 160 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 MYL12BO14950 172 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 PGRMC2O15173 223 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 ATP6V1G1O75348 118 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 EPPINO95925 133 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 CMPK1P30085 196 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 IFNGR2P38484 337 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 SEPHS1P49903 392 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 SMSP52788 366 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 DOC2BQ14184 412 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC48A1Q6P1K1 146 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 MFSD9Q8NBP5 474 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 CEP19Q96LK0 163 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC32Q9BV29 185 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 CALML5Q9NZT1 146 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 CES1P1Q9UKY3 287 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 NINQ8N4C6 2090 aa21.74■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 C2orf16Q68DN1 1984 aa21.74■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 WASHC1A8K0Z3 465 aa21.74■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 PRKYO43930 277 aa21.74■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 RAB36O95755 333 aa21.74■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 AIFM1O95831 613 aa21.74■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 GPAT3Q53EU6 434 aa21.74■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 KLHL22Q53GT1 634 aa21.74■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 C2orf27AQ580R0 203 aa21.74■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 WASH2PQ6VEQ5 465 aa21.74■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 IQCF1Q8N6M8 205 aa21.74■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 HPS1Q92902 700 aa21.74■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa21.74■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa21.74■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 C4orf51C9J302 202 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 LATO43561 262 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 ASNA1O43681 348 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 DLGAP3O95886 979 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 MPIP34949 423 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 SOX3P41225 446 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 TGM3Q08188 693 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 PPP2R2DQ66LE6 453 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC116Q8IYX3 515 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 GALNT6Q8NCL4 622 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 HTRA1Q92743 480 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 KLK6Q92876 244 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC30A2Q9BRI3 323 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 YIPF4Q9BSR8 244 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 SNX7Q9UNH6 387 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 LIPT1Q9Y234 373 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-202ENST00000399409 GPSM3Q9Y4H4 160 aa21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms