RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373433.8

RPRD1B-201, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPRD1B, Length 3,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 FERD3LQ96RJ6 166 aa10.61□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 MIXL1Q9H2W2 232 aa10.61□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM245Q9H330 911 aa10.61□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 STUB1Q9UNE7 303 aa10.61□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa10.61□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 ANKDD1BA6NHY2 528 aa10.61□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa10.61□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 ORC5O43913 435 aa10.61□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 GREM1O60565 184 aa10.61□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 CNR2P34972 360 aa10.61□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 PREPP48147 710 aa10.61□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 SF1Q15637 639 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 MLIPQ5VWP3 458 aa10.61□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 ALG1LQ6GMV1 187 aa10.61□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 COMMD7Q86VX2 200 aa10.61□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 OR6C4Q8NGE1 309 aa10.61□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 BTN2A2Q8WVV5 523 aa10.61□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 C7orf34Q96L11 122 aa10.61□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 HYLS1Q96M11 299 aa10.61□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 RHCGQ9UBD6 479 aa10.61□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 MAN2B1O00754 1011 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 SCG5P05408 212 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 NAGAP17050 411 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 EPORP19235 508 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 LHCGRP22888 699 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 KCNJ10P78508 379 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 PTSQ03393 145 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 SNTA1Q13424 505 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 SNAPC1Q16533 368 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 DUOXA1Q1HG43 343 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 PAQR6Q6TCH4 344 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 ENPP7Q6UWV6 458 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 RNF175Q8N4F7 328 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 TMIEQ8NEW7 156 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 UPRTQ96BW1 309 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM129BQ96TA1 746 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 CDCA4Q9BXL8 241 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 ANKRA2Q9H9E1 313 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 FZD4Q9ULV1 537 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 MTCH2Q9Y6C9 303 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 J3KTA2 159 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 LYRM1O43325 122 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 CSO75390 466 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 ENPP1P22413 925 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 IL32P24001 234 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 SDC2P34741 201 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 RPS21P63220 83 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 C1DQ13901 141 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 FGFBP1Q14512 234 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM122CQ6P4D5 195 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 Q7L0L9 218 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 APIPQ96GX9 242 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 WDFY2Q96P53 400 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 WACQ9BTA9 647 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 TPT1P8Q9HAU6 139 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 FZD3Q9NPG1 666 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 EQTNQ9NQ60 294 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 MGAT4AQ9UM21 535 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 LATO43561 262 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 ENTPD6O75354 484 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 SOX14O95416 240 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 NUDT14O95848 222 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 IDSP22304 550 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 ARRDC3Q96B67 414 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 CD244Q9BZW8 370 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 RACGAP1Q9H0H5 632 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 NDUFAF4Q9P032 175 aa10.6□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 C2CD4DB7Z1M9 353 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 RFPL3O75679 317 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 ACPPP15309 386 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 CRYBB2P43320 205 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 RGS1Q08116 209 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 TDGQ13569 410 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 DPPA4Q7L190 304 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 SYT14Q8NB59 555 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 AQP11Q8NBQ7 271 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF680Q8NEM1 530 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 CREB3L4Q8TEY5 395 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 BBS4Q96RK4 519 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 DOHHQ9BU89 302 aa10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
RPRD1B-201ENST00000373433 TAPBPLQ9BX59 468 aa10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms