RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRAMEF12O95522 483 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 CXCL14O95715 111 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 NUDT14O95848 222 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 WNT2P09544 360 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC35E2P0CK97 266 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 LAMP1P11279 417 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 PGAM2P15259 253 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 GDF1P27539 372 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 SAA4P35542 130 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 MAGEA9P43362 315 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 NSFP46459 744 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 PITPNBP48739 271 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 FNTAP49354 379 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC25A1P53007 311 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 VCPP55072 806 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 HAND2P61296 217 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 LYZP61626 148 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF85Q03923 595 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF33BQ06732 778 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC10A1Q14973 349 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 CD226Q15762 336 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 MICAQ29983 383 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 GSG1Q2KHT4 349 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 MS4A13Q5J8X5 152 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 NKAIN2Q5VXU1 208 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 MFSD7Q6UXD7 560 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 STOX1Q6ZVD7 989 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC91Q7Z6B0 441 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF525Q8N782 197 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLCO4A1Q96BD0 722 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF414Q96IQ9 312 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCT8L2Q96SF2 557 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 CPXM1Q96SM3 734 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM173AQ9BQD7 235 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 PAXXQ9BUH6 204 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM245Q9H330 911 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 IKZF5Q9H5V7 419 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 TIGARQ9NQ88 270 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 SENP1Q9P0U3 644 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 ERVK-18Q9QC07 812 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 SYNJ2O15056 1496 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM170AA1A519 330 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC69A6NI79 296 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 LRP3O75074 770 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATP6V1G1O75348 118 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 PDE5AO76074 875 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 HMOX1P09601 288 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 PVRP15151 417 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 AREGP15514 252 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 CNN1P51911 297 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 NPRL3Q12980 569 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 HFEQ30201 348 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATRAIDQ6UW56 229 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 CNTN4Q8IWV2 1026 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRT35Q92764 455 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 SNX21Q969T3 373 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 DTD2Q96FN9 168 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 TEX13BQ9BXU2 312 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRIM9Q9C026 710 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRPV6Q9H1D0 765 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 ESM1Q9NQ30 184 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 CENPMQ9NSP4 180 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 VNN3Q9NY84 501 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 CLEC4EQ9ULY5 219 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 MOKQ9UQ07 419 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 ENTPD4Q9Y227 616 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF175Q9Y473 711 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 RNF115Q9Y4L5 304 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 TEX264Q9Y6I9 313 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP1.82□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 MACROD2A1Z1Q3 448 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 FRG2CA6NGY1 282 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 A8MX80 341 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 E7ENQ6 273 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 NPIPA5E9PKD4 350 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP1.82□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 EI24O14681 340 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 GPAA1O43292 621 aa1.82□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 TYROBPO43914 113 aa1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms