RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298564.14

TSPAN17-201, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPAN17, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17-201ENST00000298564 MTERF3Q96E29 417 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 C1GALT1Q9NS00 363 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 DEC1Q9P2X7 70 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 TMCC3Q9ULS5 477 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 HEPACAM2A8MVW5 462 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 PRKYO43930 277 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 SH3BP5O60239 455 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP16.84■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 GPR19Q15760 415 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 RDH10Q8IZV5 341 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 OR2L2Q8NH16 312 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC25A46Q96AG3 418 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 CCDC120Q96HB5 630 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa16.83■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 HYKKA2RU49 373 aa16.83■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 NTN1O95631 604 aa16.83■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 BCHEP06276 602 aa16.83■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 PTNP21246 168 aa16.83■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF234Q14588 700 aa16.83■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 CASP12Q6UXS9 341 aa16.83■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 SZRD1Q7Z422 152 aa16.83■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC25A19Q9HC21 320 aa16.83■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC23A1Q9UHI7 598 aa16.83■□□□□ 0.29
TSPAN17-201ENST00000298564 GPR37L1O60883 481 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 OR2B3O76000 313 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 IFNW1P05000 195 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 MYOGP15173 224 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 PXNP49023 591 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 TMEM240Q5SV17 173 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 FAM71E1Q6IPT2 247 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 C11orf96Q7Z7L8 435 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 Q8N402 240 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 UPRTQ96BW1 309 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 ABCG4Q9H172 646 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 MVB12BQ9H7P6 319 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 SEC14L4Q9UDX3 406 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 ENPP4Q9Y6X5 453 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 LINC01553A4QN01 128 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 DVL2O14641 736 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 SOX18P35713 384 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 XKP51811 444 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 DPTQ07507 201 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 RBBP4Q09028 425 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 ASAH1Q13510 395 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 IL18Q14116 193 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 GAB4Q2WGN9 574 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF765Q7L2R6 523 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 NATD1Q8N6N6 113 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 OR52N2Q8NGI0 321 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 GRPEL2Q8TAA5 225 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 TM9SF4Q92544 642 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 RIPOR3Q96MK2 946 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 WACQ9BTA9 647 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 PRR14Q9BWN1 585 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 DPEP2Q9H4A9 486 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 IL3P08700 152 aa16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 ALAS2P22557 587 aa16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 AVPR1BP47901 424 aa16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 PDE7AQ13946 482 aa16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 FAM78AQ5JUQ0 283 aa16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 NANOGP1Q8N7R0 232 aa16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 C19orf18Q8NEA5 215 aa16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 REV1Q9UBZ9 1251 aa16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC23A2Q9UGH3 650 aa16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 GPR34Q9UPC5 381 aa16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 PI15O43692 258 aa16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 RPS5P46782 204 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 CTBP2P56545 445 aa16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 RAB8AP61006 207 aa16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 CNIH2Q6PI25 160 aa16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 CACUL1Q86Y37 369 aa16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 OR4D11Q8NGI4 311 aa16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 TRIM63Q969Q1 353 aa16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 KATNB1Q9BVA0 655 aa16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 MND1Q9BWT6 205 aa16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 OR52A5Q9H2C5 316 aa16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 MYNNQ9NPC7 610 aa16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 NDUFB11Q9NX14 153 aa16.82■□□□□ 0.28
TSPAN17-201ENST00000298564 MYO10Q9HD67 2058 aa16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms