RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
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RABGEF1-201ENST00000284957 IFI44Q8TCB0 444 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 NAT6Q93015 286 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 WFDC6Q9BQY6 131 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-201ENST00000284957 BCL2L10Q9HD36 194 aa8.74□□□□□ -1.01
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