RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 HTRA1Q92743 480 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC32Q9BV29 185 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 CDADC1Q9BWV3 514 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 OR52A5Q9H2C5 316 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 SIRT5Q9NXA8 310 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 CHD8Q9HCK8 2581 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF26BQ2KJY2 2108 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 RGS13O14921 159 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 DIRAS1O95057 198 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 LRATO95237 230 aa24.86■■□□□ 1.57
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CAPNS1-201ENST00000246533 FASLGP48023 281 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 WASH2PQ6VEQ5 465 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF367Q7RTV3 350 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa24.86■■□□□ 1.57
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF605Q86T29 641 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 PARP16Q8N5Y8 322 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 GGHQ92820 318 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 NAT6Q93015 286 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 CHST8Q9H2A9 424 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 TPT1P8Q9HAU6 139 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 WASH6PQ9NQA3 447 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 WASF3Q9UPY6 502 aa24.86■■□□□ 1.57
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CAPNS1-201ENST00000246533 CYP2A7P20853 494 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 ASB11Q8WXH4 323 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 CFL2Q9Y281 166 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0G2JNG1 304 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC5A10A0PJK1 596 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 KIR2DS3K7RE56 304 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 DSCR3O14972 297 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 KPNA5O15131 536 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNK2O95069 426 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 GP1BAP07359 652 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 NEK2P51955 445 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 UGT2B15P54855 530 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 HSPA14Q0VDF9 509 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 KIR2DS5Q14953 304 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 AMZ1Q400G9 498 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 TPD52L3Q96J77 140 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 EGLN2Q96KS0 407 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 C12orf66Q96MD2 445 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCG4Q9H172 646 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 VPS29Q9UBQ0 182 aa24.84■■□□□ 1.57
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CAPNS1-201ENST00000246533 SPANXN2Q5MJ10 180 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 HES3Q5TGS1 186 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 USP53Q70EK8 1073 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF438Q7Z4V0 828 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 STX19Q8N4C7 294 aa24.84■■□□□ 1.57
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CAPNS1-201ENST00000246533 UBE2FQ969M7 185 aa24.84■■□□□ 1.57
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CAPNS1-201ENST00000246533 LAMA5O15230 3695 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 SH3D21A4FU49 640 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 ADRB1P08588 477 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 CASP3P42574 277 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 RGS6P49758 472 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 SELENOWP63302 87 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 ILKQ13418 452 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 PTCHD3Q3KNS1 767 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC9B2Q86UD5 537 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 DUSP26Q9BV47 211 aa24.83■■□□□ 1.57
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CAPNS1-201ENST00000246533 KLK13Q9UKR3 277 aa24.83■■□□□ 1.57
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CAPNS1-201ENST00000246533 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 METTL4Q8N3J2 472 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 SETD6Q8TBK2 473 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 ATL1Q8WXF7 558 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 CXorf40BQ96DE9 158 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAPPC4Q9Y296 219 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A075B6Q4 140 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 EFCAB10A6NFE3 127 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5K4A6NMS3 321 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 GFYI3L273 518 aa24.82■■□□□ 1.56
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