RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171404.7

Gtf3c4-204, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c4, Length 7,127 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Sez6Q7TSK2 991 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Frs2Q8C180 508 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Zfyve21Q8VCM3 234 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Atg5Q99J83 275 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Hint2Q9D0S9 163 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Gm8225D3Z536 292 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Vmn2r99H3BK37 856 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Tcn2O88968 430 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Slc12a3P59158 1002 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Pde12Q3TIU4 608 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Abcb7Q61102 752 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Rad54bQ6PFE3 886 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 DpcdQ8BPA8 203 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Rbm12Q8R4X3 992 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Ppp1r14aQ91VC7 147 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 RTRAFQ9CQE8 244 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Olfr930Q9EQ99 308 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 A0A1Y7VIT9 351 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Olfr519K7N645 319 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Syndig1lQ3USQ7 237 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Tas2r135Q7TQA9 312 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 B3gnt5Q8BGY6 376 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Adgrg2Q8CJ12 1009 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 TapbplQ8VD31 451 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Rbm39Q8VH51 530 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Nt5c1bQ91YE9 573 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Olfr619E9PV95 320 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Olfr1471F6QVZ8 314 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Gpr52P0C5J4 361 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Rhbdf1Q6PIX5 856 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Rxfp3Q8BGE9 472 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Znf784Q8BI69 297 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Ston2Q8BZ60 895 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Csnka2ipQ8CH19 720 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Timm22Q9CQ85 194 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Gm5724L7N264 670 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Kcnc1P15388 511 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Pou3f4P62515 361 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Trim24Q64127 1051 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Mon1bQ8BMQ8 553 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Npsr1Q8BZP8 371 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Bpifb2Q8C1E1 462 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Irf2bplQ8K3X4 775 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Olfr459Q924H8 314 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Hsbp1Q9CQZ1 76 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 OxsmQ9D404 459 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Gm45716A0A1B0GRQ0 93 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Omt2aF6ZJR3 104 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Rit1P70426 219 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 B3gnt3Q5JCS9 372 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Mfsd13aQ6PDE8 519 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Tmbim1Q8BJZ3 309 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Il17rcQ8K4C2 698 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Vsx1Q91V10 363 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Msantd3Q9CR78 275 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Fundc2Q9D6K8 151 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Dclk1Q9JLM8 756 aa15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Gpr15Q0VDU3 360 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Xrra1Q3U3V8 786 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Commd3Q63829 195 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Kti12Q9D1R2 351 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 SncgQ9Z0F7 123 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Syn1O88935 706 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 AnpepP97449 966 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 LchnQ3UHG7 455 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Q3UUX7 111 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Ephx3Q3V1F8 367 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 CishQ62225 257 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Slc16a9Q7TM99 508 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Mppe1Q80XL7 396 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Spz1Q99MY0 378 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Cmtm8Q9CZR4 173 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Q9D112 206 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Mecp2Q9Z2D6 484 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Olfr1188A2AV10 312 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Gpr25P0C5I1 358 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Irf2P23906 349 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 St3gal1P54751 337 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Epha5Q60629 876 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Taf6Q62311 678 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Kansl1Q80TG1 1036 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Q8K207 121 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Clstn3Q99JH7 956 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Vmn2r18E9Q280 788 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 AmbnO55189 407 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Rad52P43352 420 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Kctd13Q8BGV7 329 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Aifm2Q8BUE4 373 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Olfr691Q8VGW5 322 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Isoc1Q91V64 297 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Mri1Q9CQT1 369 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Olfr948Q9EQ95 321 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Slco1c1Q9ERB5 715 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Mtg2A2AFK4 405 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Gm42791D3YYB5 209 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Olfr730E9Q8M3 318 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 TyrobpO54885 114 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Ctbp2P56546 445 aa15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 G6pdxQ00612 515 aa15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.1 ms