RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	PHF21B	Q96EK2	531 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	CDK15	Q96Q40	435 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	FOXC2	Q99958	501 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	PSME2	Q9UL46	239 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	APC	P25054	2843 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	FBN2	P35556	2912 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	GNB5	O14775	395 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	CTAG2	O75638	210 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	ACSL3	O95573	720 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	EPPIN	O95925	133 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	CEBPE	Q15744	281 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	FRG2	Q64ET8	278 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	FRG2B	Q96QU4	278 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	RASSF1	Q9NS23	344 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TARDBP-231	ENST00000639599	GTF3C1	Q12789	2109 aa		13.46	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	F8	P00451	2351 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599		A6NNC1	897 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	SYT5	O00445	386 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	PGRMC2	O15173	223 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	ESRRB	O95718	433 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	CYP4B1	P13584	511 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	CPM	P14384	443 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	TACR1	P25103	407 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	OPRM1	P35372	400 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	TIMP3	P35625	211 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	CASP3	P42574	277 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	CPA2	P48052	419 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	NNAT	Q16517	81 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	GNRHR2	Q96P88	292 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	TIMP4	Q99727	224 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	PROK2	Q9HC23	129 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	PRODH2	Q9UF12	536 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	SNX6	Q9UNH7	406 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	ESYT3	A0FGR9	886 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	C1orf226	A1L170	272 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599		H0Y3Z8	333 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	STX16	O14662	325 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	OTC	P00480	354 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	HPN	P05981	417 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	ABCD3	P28288	659 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	KRT20	P35900	424 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	ALDH9A1	P49189	494 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	WNT3	P56703	355 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	FUT7	Q11130	342 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TARDBP-231	ENST00000639599	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		13.44	□□□□□ -0.26

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