RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 QPCTQ16769 361 aa6.1□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 SEZ6Q53EL9 994 aa6.1□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 GDPD4Q6W3E5 623 aa6.1□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 SYT14Q8NB59 555 aa6.1□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 LRFN5Q96NI6 719 aa6.1□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 CLSTN3Q9BQT9 956 aa6.1□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 PDE7BQ9NP56 450 aa6.1□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 ADAP2Q9NPF8 381 aa6.1□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.1□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 A0A1W2PPH5 198 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 FKTNO75072 461 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 RPS17P08708 135 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 ALAS2P22557 587 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 IL3RAP26951 378 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 ARL2P36404 184 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 CHAF1BQ13112 559 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 ABHD15Q6UXT9 468 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 NLRP8Q86W28 1048 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 CANT1Q8WVQ1 401 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 CDK15Q96Q40 435 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 SNX18Q96RF0 628 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 TMED9Q9BVK6 235 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 BRF2Q9HAW0 419 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 ERVK-18Q9QC07 812 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 IL36AQ9UHA7 158 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 LYRM1O43325 122 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 ERI3O43414 337 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 F10P00742 488 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 ELOCQ15369 112 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 FOXR1Q6PIV2 292 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 OR4F6Q8NGB9 312 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 OR13J1Q8NGT2 312 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 HAS1Q92839 578 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 MGLLQ99685 303 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 PELI2Q9HAT8 420 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 TO15178 435 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 RETREG3Q86VR2 466 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 THEM6Q8WUY1 208 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 OR1E3Q8WZA6 343 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 PGAM5Q96HS1 289 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 MCHR1Q99705 422 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 HERPUD2Q9BSE4 406 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 CUTCQ9NTM9 273 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 ETV7Q9Y603 341 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 AURKAO14965 403 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 DFFBO76075 338 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 NCK1P16333 377 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 IMPA1P29218 277 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 DCAF7P61962 342 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 GINS1Q14691 196 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 LY6KQ17RY6 165 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 BRICD5Q6PL45 260 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 NAT8LQ8N9F0 302 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 OR14C36Q8NHC7 312 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 LRCH3Q96II8 777 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 SLC22A12Q96S37 553 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 NGBQ9NPG2 151 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 IL26Q9NPH9 171 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 CPQQ9Y646 472 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 SEC14L5O43304 696 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 ANGPTL7O43827 346 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 SH3BGRLO75368 114 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 PROS1P07225 676 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 NELFEP18615 380 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 CDH15P55291 814 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 FXYD6P3P58550 94 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 NPRL3Q12980 569 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 TGFBIQ15582 683 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 OR6V1Q8N148 313 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 POGLUT1Q8NBL1 392 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 KCT2Q8NC54 265 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 GPR148Q8TDV2 347 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 RSPRY1Q96DX4 576 aa6.09□□□□□ -1.43
SCN2A-209ENST00000636071 LURAP1Q96LR2 239 aa6.09□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms