RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PR48	441 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	SH3D21	A4FU49	640 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	FRS3	O43559	492 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	CLEC3A	O75596	197 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	CERS1	P27544	350 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	NTS	P30990	170 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	S100A5	P33763	92 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM23	P36406	574 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	ILK	Q13418	452 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	NATD1	Q8N6N6	113 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	CRELD1	Q96HD1	420 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	PSD2	Q9BQI7	771 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	WWP2	O00308	870 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	FAAH	O00519	579 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	MAN2B1	O00754	1011 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	TBX19	O60806	448 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	APOL3	O95236	402 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	CEACAM5	P06731	702 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	CHRM4	P08173	479 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	SSX1	Q16384	188 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	IQCH	Q86VS3	1027 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	KRT73	Q86Y46	540 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PQU0	124 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	CCRL2	O00421	344 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	NTN1	O95631	604 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	GDI1	P31150	447 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	TEK	Q02763	1124 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	POC5	Q8NA72	575 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	ZG16B	Q96DA0	208 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	GPA33	Q99795	319 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	UPK1B	O75841	260 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	EPPIN	O95925	133 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	ALOX12	P18054	663 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	MMP11	P24347	488 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	SERPINB1	P30740	379 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	FUT5	Q11128	374 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	HYAL2	Q12891	473 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC32	Q14392	662 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	STEAP3	Q658P3	488 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	ISM1	B1AKI9	464 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	PRKY	O43930	277 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	GPX5	O75715	221 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	AIFM1	O95831	613 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	APOD	P05090	189 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	DRD2	P14416	443 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	ATCAY	Q86WG3	371 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		12.34	□□□□□ -0.43
BRF1-222	ENST00000635152	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		12.34	□□□□□ -0.43

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