RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 BEST3Q8N1M1 668 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 OR9I1Q8NGQ6 314 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 SPDL1Q96EA4 605 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR137Q96N19 417 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB18Q99592 522 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 DMRT3Q9NQL9 472 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 ASPDHA6ND91 283 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 HAT1O14929 419 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 MGRN1O60291 552 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 MAN1A2O60476 641 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 MYO1DO94832 1006 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 C8orf89P0DMQ9 161 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 ST13P50502 369 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 NUDT2P50583 147 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 CSNK1G2P78368 415 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 RBPJQ06330 500 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 TUBA3CQ13748 450 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 TUBA3EQ6PEY2 450 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 PLD3Q8IV08 490 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 SIAH3Q8IW03 269 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 SCUBE1Q8IWY4 988 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 APIPQ96GX9 242 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A088AWK7 358 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 TRBC2A0A5B9 178 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2W5A6NFC9 320 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 EEDO75530 441 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 SEMA3DO95025 777 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 IL6P05231 212 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 PCNAP12004 261 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 ARFIP1P53367 373 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 AP2B1P63010 937 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 ACSM2AQ08AH3 577 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATS1Q496A3 300 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 ACER2Q5QJU3 275 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 ACSM2BQ68CK6 577 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 REP15Q6BDI9 236 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 VN1R4Q7Z5H5 301 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 DEFB107AQ8IZN7 70 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D19Q8N5T2 526 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 DPP10Q8N608 796 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM13CQ8NE31 585 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 OR9A4Q8NGU2 314 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 SUN3Q8TAQ9 357 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 SCMH1Q96GD3 660 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 TEX37Q96LM6 180 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 THTPAQ9BU02 230 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 DPY30Q9C005 99 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 GID8Q9NWU2 228 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 AHSPQ9NZD4 102 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 MEMO1Q9Y316 297 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 GTF3C1Q12789 2109 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 H7BY64 318 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 MRASO14807 208 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 ANGPT2O15123 496 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 CFLARO15519 480 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 STATHP02808 62 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 CAPN3P20807 821 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 IL12AP29459 219 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 VPS26BQ4G0F5 336 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 SPPL2CQ8IUH8 684 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 LIX1Q8N485 282 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 TESCQ96BS2 214 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 PRAP1Q96NZ9 151 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR41Q9HAD4 459 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKDD1BA6NHY2 528 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC154A6NI56 674 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 A8MUI8 341 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNHIT1O43257 154 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 CLEC3AO75596 197 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 PRPS1L1P21108 318 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 GRK3P35626 688 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 AHRP35869 848 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 CD96P40200 585 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 ASMTP46597 345 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS13P62277 151 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 DPY19L1Q2PZI1 675 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 DEPDC1Q5TB30 811 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 ULK2Q8IYT8 1036 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 METTL4Q8N3J2 472 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 FRMD6Q96NE9 622 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 SPNS1Q9H2V7 528 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 TEKT2Q9UIF3 430 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 NR5A2O00482 541 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 CLDN14O95500 239 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 CYC1P08574 325 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 SDC1P18827 310 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 SSTR2P30874 369 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-216ENST00000628306 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
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