RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623253.4_PAR_Y

CD99-211, Transcript of CD99 molecule (Xg blood group), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD99, Length 573 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y DCAF7P61962 342 aa14.8□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PCDH1Q08174 1060 aa14.8□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y C2orf54Q08AI8 447 aa14.8□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RCAN2Q14206 197 aa14.8□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y E2F2Q14209 437 aa14.8□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SETDB1Q15047 1291 aa14.8□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y DCST1Q5T197 706 aa14.8□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y C3orf62Q6ZUJ4 267 aa14.8□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TAOK1Q7L7X3 1001 aa14.8□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CTAGE3PQ8IX95 158 aa14.8□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PRR22Q8IZ63 422 aa14.8□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TEX9Q8N6V9 391 aa14.8□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TP53INP1Q96A56 240 aa14.8□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y WDYHV1Q96HA8 205 aa14.8□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y UBQLN3Q9H347 655 aa14.8□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ACTR8Q9H981 624 aa14.8□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GRHL1Q9NZI5 618 aa14.8□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ASB4Q9Y574 426 aa14.8□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TMPRSS11DO60235 418 aa14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ERN1O75460 977 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SLC35E2BP0CK96 405 aa14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SLC35E2P0CK97 266 aa14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CYP4B1P13584 511 aa14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KRT15P19012 456 aa14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y FLNAP21333 2647 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CASQ1P31415 396 aa14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CASP3P42574 277 aa14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CPA2P48052 419 aa14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NAGLUP54802 743 aa14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RPP38P78345 283 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PHEXP78562 749 aa14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SORDQ00796 357 aa14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CAV1Q03135 178 aa14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y FNDC7Q5VTL7 733 aa14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y LUZP2Q86TE4 346 aa14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ISCA2Q86U28 154 aa14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GALNT12Q8IXK2 581 aa14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y VWA5B2Q8N398 1253 aa14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZNF441Q8N8Z8 693 aa14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y C9orf106Q8NAJ2 232 aa14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RAB17Q9H0T7 212 aa14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CALHM2Q9HA72 323 aa14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CXorf21Q9HAI6 301 aa14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NMRAL1Q9HBL8 299 aa14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa14.79□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y A0A0A6YYD5 115 aa14.78□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y A0A1W2PS29 197 aa14.78□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CASKO14936 926 aa14.78□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PGRMC2O15173 223 aa14.78□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y AIFM1O95831 613 aa14.78□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GBAP04062 536 aa14.78□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PIK3R1P27986 724 aa14.78□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GALNSP34059 522 aa14.78□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SPRP35270 261 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GCKP35557 465 aa14.78□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y BSGP35613 385 aa14.78□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PLTPP55058 493 aa14.78□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GPX6P59796 221 aa14.78□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y FOXF2Q12947 444 aa14.78□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y DLG1Q12959 904 aa14.78□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SLMAPQ14BN4 828 aa14.78□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NHSL2Q5HYW2 709 aa14.78□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GRTP1Q5TC63 336 aa14.78□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TIGD3Q6B0B8 471 aa14.78□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ANGPTL8Q6UXH0 198 aa14.78□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CMC1Q7Z7K0 106 aa14.78□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y OR1J4Q8NGS1 313 aa14.78□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y OR10A5Q9H207 317 aa14.78□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y METTL7AQ9H8H3 244 aa14.78□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y JKAMPQ9P055 326 aa14.78□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y IKBKGQ9Y6K9 419 aa14.78□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NINQ8N4C6 2090 aa14.77□□□□□ -0.04
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y C2orf72A6NCS6 295 aa14.77□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KERAO60938 352 aa14.77□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y IL18BPO95998 194 aa14.77□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y HRGP04196 525 aa14.77□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CT62P0C5K7 136 aa14.77□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CD53P19397 219 aa14.77□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NT5EP21589 574 aa14.77□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y STX2P32856 288 aa14.77□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SLCO1A2P46721 670 aa14.77□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NEK2P51955 445 aa14.77□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ETF1P62495 437 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SRYQ05066 204 aa14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms