RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 MEOX1P50221 254 aa23■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 DUSP2Q05923 314 aa23■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 CEBPEQ15744 281 aa23■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 UGT3A2Q3SY77 523 aa23■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 Q6ZSR9 355 aa23■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 CLYBLQ8N0X4 340 aa23■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 TP53INP1Q96A56 240 aa23■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 GPR137Q96N19 417 aa23■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 CENPHQ9H3R5 247 aa23■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 MYNNQ9NPC7 610 aa23■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 C1orf109Q9NX04 203 aa23■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 OSGIN2Q9Y236 505 aa23■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 SLC5A6Q9Y289 635 aa23■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 TRAF6Q9Y4K3 522 aa23■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa23■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 TM9SF1O15321 606 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 UNC5CO95185 931 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 STSP08842 583 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 ZNF24P17028 368 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 DDCP20711 480 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 KCNK10P57789 538 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 RNFT1Q5M7Z0 435 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 NOXRED1Q6NXP6 359 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 LYPD8Q6UX82 237 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 C17orf47Q8NEP4 570 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 C16orf52Q8NHV5 167 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 DEPPQ9NTK1 212 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 FIS1Q9Y3D6 152 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 SEC22BO75396 215 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 WISP2O76076 250 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 ARRB2P32121 409 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 SOX18P35713 384 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 SERPINB4P48594 390 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 FAM71E1Q6IPT2 247 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 FAM180BQ6P0A1 224 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 FAM111BQ6SJ93 734 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 IKBIPQ70UQ0 350 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 OR2T11Q8NH01 316 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 ZNF675Q8TD23 568 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 SSC4DQ8WTU2 575 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 BRINP2Q9C0B6 783 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 LRTM1Q9HBL6 345 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 GIMAP4Q9NUV9 329 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 TAS2R7Q9NYW3 318 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 CFL2Q9Y281 166 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 NPIPA5E9PKD4 350 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 BIRC5O15392 142 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 FBXO45P0C2W1 286 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 DHRS4L1P0CG22 281 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 C4orf17Q53FE4 359 aa22.98■■□□□ 1.27
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PMS1-220ENST00000618056 TAGAPQ8N103 731 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 TWIST2Q8WVJ9 160 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 ADIPOR1Q96A54 375 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
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PMS1-220ENST00000618056 FCRL1Q96LA6 429 aa22.98■■□□□ 1.27
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PMS1-220ENST00000618056 NPIPA1Q9UND3 350 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 TMEM233B4DJY2 109 aa22.97■■□□□ 1.27
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PMS1-220ENST00000618056 GPR85P60893 370 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 C2orf80Q0P641 193 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 SH2D4BQ5SQS7 431 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
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PMS1-220ENST00000618056 TMED5Q9Y3A6 229 aa22.97■■□□□ 1.27
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PMS1-220ENST00000618056 ASNA1O43681 348 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 ZWINTO95229 277 aa22.96■■□□□ 1.27
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PMS1-220ENST00000618056 GPX3P22352 226 aa22.96■■□□□ 1.27
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PMS1-220ENST00000618056 LTB4RQ15722 352 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 ZNF628Q5EBL2 1059 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 OR2M7Q8NG81 312 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 CDC26Q8NHZ8 85 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 PAQR8Q8TEZ7 354 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 MIEF1Q9NQG6 463 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 PFDN4Q9NQP4 134 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-220ENST00000618056 FREM3P0C091 2139 aa22.96■■□□□ 1.27
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