RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR9A4Q8NGU2 314 aa15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 C9orf16Q9BUW7 83 aa15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 A4GALTQ9NPC4 353 aa15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 ENAMQ9NRM1 1142 aa15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 STARD5Q9NSY2 213 aa15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 CUTCQ9NTM9 273 aa15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 EXD2Q9NVH0 621 aa15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 C15orf41Q9Y2V0 281 aa15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 ITPR1Q14643 2758 aa15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF860A6NHJ4 632 aa15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 I3L1I5 382 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 SGK494L7N484 410 aa15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 ASNA1O43681 348 aa15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR10H2O60403 315 aa15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 RDH16O75452 317 aa15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 SERPINB7O75635 380 aa15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 TIPRLO75663 272 aa15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 CDK4P11802 303 aa15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 ACADSP16219 412 aa15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 ITGA2P17301 1181 aa15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 CDK9P50750 372 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRKAG1P54619 331 aa15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 GUSBP11Q6P575 273 aa15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 PACRGLQ8N7B6 248 aa15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 NUP43Q8NFH3 380 aa15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 IFI44Q8TCB0 444 aa15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 COL26A1Q96A83 441 aa15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 PKP2Q99959 881 aa15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 CHID1Q9BWS9 393 aa15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 NDOR1Q9UHB4 597 aa15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 RIMS3Q9UJD0 308 aa15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 LIPT1Q9Y234 373 aa15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 NBEAQ8NFP9 2946 aa15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 FASNP49327 2511 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 A8MU76 341 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 H0YJX3 145 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLOD2O00469 737 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 COQ9O75208 318 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 TNFRSF21O75509 655 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 C8orf89P0DMQ9 161 aa15.75■□□□□ 0.11
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TRAPPC3-210ENST00000617904 NT5EP21589 574 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 GABRA4P48169 554 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 HSD17B7P56937 341 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 OLR1P78380 273 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 HPCAP84074 193 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC13A2Q13183 592 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 SERTAD2Q14140 314 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATP6AP1Q15904 470 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 IZUMO2Q6UXV1 221 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC80Q76M96 950 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 PTOV1Q86YD1 416 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 ANKFN1Q8N957 763 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 LRTOMTQ8WZ04 291 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 ELP4Q96EB1 424 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 CRELD1Q96HD1 420 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 MAGED4Q96JG8 741 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF681Q96N22 645 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 MS4A4EQ96PG1 132 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 ACTRT3Q9BYD9 372 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 CHST8Q9H2A9 424 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 EPS8L2Q9H6S3 715 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 SYNPO2LQ9H987 977 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLAMF7Q9NQ25 335 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 FGF21Q9NSA1 209 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 DNAJB9Q9UBS3 223 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 ACSL6Q9UKU0 697 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 USP22Q9UPT9 525 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 A0A087WV62 115 aa15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 CLOCKO15516 846 aa15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 TPST1O60507 370 aa15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 CTNSO60931 367 aa15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRKD3O94806 890 aa15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATP1B1P05026 303 aa15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 GP1BAP07359 652 aa15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC35E2P0CK97 266 aa15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 NR2F1P10589 423 aa15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 ALAS2P22557 587 aa15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 CRISP3P54108 245 aa15.74■□□□□ 0.11
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