RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615637.2

FOXD1-202, Transcript of forkhead box D1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene FOXD1, Length 2,272 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1-202ENST00000615637 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa28.88■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 TMC8Q8IU68 726 aa28.88■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 OR4K5Q8NGD3 323 aa28.88■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 UBE2E3Q969T4 207 aa28.88■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 SCLYQ96I15 445 aa28.88■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 NEUROD4Q9HD90 331 aa28.88■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa28.88■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 C5AR2Q9P296 337 aa28.88■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 EPHX1P07099 455 aa28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 CTSLP07711 333 aa28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 GIMAP4Q9NUV9 329 aa28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 COMMD3Q9UBI1 195 aa28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 RTCAO00442 366 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 ACP2P11117 423 aa28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 ACADMP11310 421 aa28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 PSKH1P11801 424 aa28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 GABRA5P31644 462 aa28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 GZMKP49863 264 aa28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 CNTN1Q12860 1018 aa28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 CKAP5Q14008 2032 aa28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 NDUFA9Q16795 377 aa28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 POM121L1PQ3SYA9 428 aa28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 SPDYE7PQ495Y7 208 aa28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 LYPD8Q6UX82 237 aa28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 ADIPOR2Q86V24 386 aa28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 Q8N402 240 aa28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 UFD1Q92890 307 aa28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 TM4SF18Q96CE8 201 aa28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 RNFT2Q96EX2 444 aa28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 ISYNA1Q9NPH2 558 aa28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa28.87■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 PROM1O43490 865 aa28.86■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 SLC28A2O43868 658 aa28.86■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 FAM157BP0CG42 384 aa28.86■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 MAPK12P53778 367 aa28.86■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 RAB40BQ12829 278 aa28.86■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 TRIQKQ629K1 86 aa28.86■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 IQCHQ86VS3 1027 aa28.86■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 SMPDL3AQ92484 453 aa28.86■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 PPP1R16AQ96I34 528 aa28.86■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa28.86■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 A0A1W2PRU2 124 aa28.86■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 LILRB5O75023 590 aa28.86■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 P2RY14Q15391 338 aa28.86■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 SNAPC1Q16533 368 aa28.86■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 SYPL1Q16563 259 aa28.86■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 DUSP6Q16828 381 aa28.86■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa28.86■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 TBC1D19Q8N5T2 526 aa28.86■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 C19orf18Q8NEA5 215 aa28.86■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 TMEM163Q8TC26 289 aa28.86■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa28.86■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 CCL26Q9Y258 94 aa28.86■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa28.86■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 HTR2BP41595 481 aa28.85■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 TNK1Q13470 666 aa28.85■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 FAM214AQ32MH5 1076 aa28.85■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 FAM129CQ86XR2 697 aa28.85■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 MORN4Q8NDC4 146 aa28.85■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 DUSP18Q8NEJ0 188 aa28.85■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 FNDC11Q9BVV2 318 aa28.85■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 MALT1Q9UDY8 824 aa28.85■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 A0A0X1KG70 313 aa28.85■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 HPGDSO60760 199 aa28.85■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 TBX19O60806 448 aa28.85■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 ELFN1P0C7U0 828 aa28.85■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 OR12D1P0DN82 309 aa28.85■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 MMP12P39900 470 aa28.85■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 TMEM215Q68D42 235 aa28.85■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 LHX8Q68G74 356 aa28.85■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 LIPIQ6XZB0 460 aa28.85■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 KIF18BQ86Y91 864 aa28.85■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 SLC46A2Q9BY10 475 aa28.85■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 EPHX3Q9H6B9 360 aa28.85■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 NIPAL2Q9H841 368 aa28.85■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 PRODHO43272 600 aa28.84■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 CD79BP40259 229 aa28.84■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 IL12RB1P42701 662 aa28.84■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 SMSP52788 366 aa28.84■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 UAP1L1Q3KQV9 507 aa28.84■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa28.84■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa28.84■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 C1orf94Q6P1W5 598 aa28.84■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 IL17FQ96PD4 163 aa28.84■■■□□ 2.21
FOXD1-202ENST00000615637 AHSPQ9NZD4 102 aa28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms