RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 DTLQ9NZJ0 730 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 A0A096LPI6 279 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MEGF11A6BM72 1044 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 BRINP1O60477 761 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 RHCEP18577 417 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MFSD13AQ14CX5 517 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 DEFB128Q7Z7B8 93 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 THEM6Q8WUY1 208 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 B3GNT2Q9NY97 397 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SLC22A14Q9Y267 594 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 KDM3BQ7LBC6 1761 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CNTN5O94779 1100 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CD48P09326 243 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CASP7P55210 303 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MC2RQ01718 297 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 BAMBIQ13145 260 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GPR157Q5UAW9 335 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 OR8K5Q8NH50 307 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 KIAA1191Q96A73 305 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 B3GNT5Q9BYG0 378 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 DUSP22Q9NRW4 184 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 EPHA6Q9UF33 1036 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TBC1D3EA0A087X179 549 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRT-209ENST00000612229 TBC1D3LB9A6J9 549 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRT-209ENST00000612229 EGFP01133 1207 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TBC1D3HP0C7X1 549 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 DDCP20711 480 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 IL32P24001 234 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 BDKRB2P30411 391 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM236Q5W0B7 351 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SLC43A2Q8N370 569 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PEX13Q92968 403 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SLC17A6Q9P2U8 582 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ASXL3Q9C0F0 2248 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 BLACEA4D250 179 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GPR89AB7ZAQ6 455 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CDK14O94921 469 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GPR89BP0CG08 455 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 DPEP1P16444 411 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 KCNJ5P48544 419 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NIPAL4Q0D2K0 466 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 WDR45BQ5MNZ6 344 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SLC27A4Q6P1M0 643 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SMPDL3AQ92484 453 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRT-209ENST00000612229 IL12RB2Q99665 862 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SEPT4O43236 478 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 OR5H8P0DN80 308 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PRKCHP24723 683 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PRPS1P60891 318 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 FAM129CQ86XR2 697 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 LFNGQ8NES3 379 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 HAS2Q92819 552 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ACBD6Q9BR61 282 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NMUR1Q9HB89 426 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ESPL1Q14674 2120 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 FUOMA2VDF0 154 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MED6O75586 246 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NSA2O95478 260 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PTHP01270 115 aa6.69□□□□□ -1.34
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