RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	HOXC12	P31275	282 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-233	ENST00000602338	CASP3	P42574	277 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-233	ENST00000602338	SLCO1A2	P46721	670 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-233	ENST00000602338	MASP1	P48740	699 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-233	ENST00000602338	NAGLU	P54802	743 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-233	ENST00000602338	SORD	Q00796	357 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-233	ENST00000602338	IRF9	Q00978	393 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-233	ENST00000602338	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-233	ENST00000602338	FOXF2	Q12947	444 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-233	ENST00000602338	BIK	Q13323	160 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-233	ENST00000602338	KEAP1	Q14145	624 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-233	ENST00000602338	POU4F3	Q15319	338 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-233	ENST00000602338	NNAT	Q16517	81 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-233	ENST00000602338	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-233	ENST00000602338	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-233	ENST00000602338	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-233	ENST00000602338	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-233	ENST00000602338	CDKL2	Q92772	493 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-233	ENST00000602338	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC46	Q96FV0	321 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-233	ENST00000602338	DPH5	Q9H2P9	285 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-233	ENST00000602338	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-233	ENST00000602338	SNX15	Q9NRS6	342 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-233	ENST00000602338	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-233	ENST00000602338	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-233	ENST00000602338	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-233	ENST00000602338	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTLL3-233	ENST00000602338		H0YIV9	168 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	GNB5	O14775	395 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	ZSCAN12	O43309	604 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	HRG	P04196	525 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CD53	P19397	219 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	GPX3	P22352	226 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CTSS	P25774	331 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	ABCD3	P28288	659 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	GALNS	P34059	522 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	PIK3CG	P48736	1102 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	NEK2	P51955	445 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	ARFIP1	P53367	373 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	DCAF7	P61962	342 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	FUT7	Q11130	342 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	SETDB1	Q15047	1291 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	RAPH1	Q70E73	1250 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	BIVM	Q86UB2	503 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	NUDT13	Q86X67	352 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	KIF18B	Q86Y91	864 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	TP53INP1	Q96A56	240 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	NXNL1	Q96CM4	212 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CENPK	Q9BS16	269 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	ACTR8	Q9H981	624 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	GALNT8	Q9NY28	637 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	EDAR	Q9UNE0	448 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC188	H7C350	402 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	SNX4	O95219	450 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	S1PR1	P21453	382 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	PTGDS	P41222	190 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CUL3	Q13618	768 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	TOMM20	Q15388	145 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	PFKFB4	Q16877	469 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	LIPJ	Q5W064	366 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CYS1	Q717R9	158 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	PACS2	Q86VP3	889 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	PPM1N	Q8N819	430 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	C18orf12	Q96KH6	178 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	OR10A5	Q9H207	317 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		10.88	□□□□□ -0.67

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