RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 CYR61O00622 381 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 P2RX6O15547 441 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 AKAP10O43572 662 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 TMPRSS11DO60235 418 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 OR10H2O60403 315 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 COQ9O75208 318 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 CBX6O95503 412 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 AIFM1O95831 613 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 ATP1B1P05026 303 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 RAB40ALP0C0E4 278 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 TACR1P25103 407 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 CERS1P27544 350 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 PGM1P36871 562 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 FRKP42685 505 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 XKP51811 444 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 PSME3P61289 254 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 RBBP4Q09028 425 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 CEBPEQ15744 281 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 MTX3Q5HYI7 312 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 SPANXN4Q5MJ08 99 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 LRIF1Q5T3J3 769 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 ATAD3BQ5T9A4 648 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 REP15Q6BDI9 236 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 QSOX2Q6ZRP7 698 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 OVCH1Q7RTY7 1134 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 SERPINA11Q86U17 422 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 PROSER1Q86XN7 944 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 FUNDC1Q8IVP5 155 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 CA13Q8N1Q1 262 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 OR7G1Q8NGA0 311 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 OR4A15Q8NGL6 344 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 OR9A4Q8NGU2 314 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 STK35Q8TDR2 534 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 OIT3Q8WWZ8 545 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 GTF2H4Q92759 462 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 RCN3Q96D15 328 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 C10orf90Q96M02 699 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 CGREF1Q99674 301 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 CTRCQ99895 268 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 ULBP3Q9BZM4 244 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 LHX9Q9NQ69 397 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 TAS2R1Q9NYW7 299 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 CALML5Q9NZT1 146 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 TRPC4Q9UBN4 977 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 PRODH2Q9UF12 536 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 KCND3Q9UK17 655 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 FBXW2Q9UKT8 454 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 LOXL2Q9Y4K0 774 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 ATG4BQ9Y4P1 393 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 H3BMH7 237 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 SGK494L7N484 410 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 RTCAO00442 366 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 PLOD2O00469 737 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 EMC8O43402 210 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 FOXS1O43638 330 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 ASNA1O43681 348 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 PLOD3O60568 738 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 SH3BGRLO75368 114 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 RDH16O75452 317 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 PDE9AO76083 593 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 LRATO95237 230 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 AK1P00568 194 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 FTH1P19P0C7X4 201 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 T-ENOLP0DO92 83 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 LAMP1P11279 417 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 MYF5P13349 255 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 ICAM2P13598 275 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 CPMP14384 443 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 IL1RNP18510 177 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 ME2P23368 584 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 RORAP35398 523 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 GNALP38405 381 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 XCR1P46094 333 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms