RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 DCAF12Q5T6F0 453 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 SZRD1Q7Z422 152 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 HIPK4Q8NE63 616 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 ADCY4Q8NFM4 1077 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 OR7G2Q8NG99 324 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 KAT2AQ92830 837 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 FKBP10Q96AY3 582 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 PTCHD1Q96NR3 888 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 MS4A4EQ96PG1 132 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 CTRCQ99895 268 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC187A0A096LP49 1063 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 AGRPO00253 132 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 UPK1AO00322 258 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 UMPSP11172 480 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP6V1B2P21281 511 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 KHKP50053 298 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 CYP2R1Q6VVX0 501 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 GALNT12Q8IXK2 581 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 METTL25Q8N6Q8 603 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 DEFB124Q8NES8 71 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC26A1Q9H2B4 701 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC22A11Q9NSA0 550 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 TGFBR3LH3BV60 316 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 MEN1O00255 615 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 JRKO75564 520 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 CYC1P08574 325 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 ARAFP10398 606 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 MATN1P21941 496 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 AP2B1P63010 937 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 FHL5Q5TD97 284 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 DHRS13Q6UX07 377 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 OVCH1Q7RTY7 1134 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 PLPP5Q8NEB5 264 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 FIG4Q92562 907 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 DDA1Q9BW61 102 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 CXorf21Q9HAI6 301 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 ASNA1O43681 348 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 CREG1O75629 220 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 NCK1P16333 377 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 MAOAP21397 527 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 RHAGQ02094 409 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 MGAT2Q10469 447 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 MINDY4Q4G0A6 757 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 SPPL2CQ8IUH8 684 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 VWA5B2Q8N398 1253 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 RIT1Q92963 219 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 MAGED4Q96JG8 741 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 TAAR9Q96RI9 348 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 A4GALTQ9NPC4 353 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 NECTIN3Q9NQS3 549 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 KNTC1P50748 2209 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM247A6NEH6 219 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 SOX30O94993 753 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 GPIP06744 558 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 PRKAG1P54619 331 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 VWA2Q5GFL6 755 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 MFSD4BQ5TF39 518 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 HES3Q5TGS1 186 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXW10Q5XX13 1052 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 LGI4Q8N135 537 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 HORMAD2Q8N7B1 307 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 STT3BQ8TCJ2 826 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 GIMAP5Q96F15 307 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 ACTRT3Q9BYD9 372 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 S100A14Q9HCY8 104 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF639Q9UID6 485 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-206ENST00000588815 DUXAA6NLW8 204 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 COQ9O75208 318 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 AGR2O95994 175 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 JMJD7P0C870 316 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 PTGER1P34995 402 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM111BQ6SJ93 734 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 SLCO6A1Q86UG4 719 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 NETO1Q8TDF5 533 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 NCLNQ969V3 563 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM162AQ96A26 154 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 OR51I1Q9H343 314 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 HMGN4O00479 90 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-206ENST00000588815 NUDT7P0C024 238 aa29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms