RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 DEFB127Q9H1M4 99 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 BCAP29Q9UHQ4 241 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 TINAGQ9UJW2 476 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF225Q9UK10 706 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 CAPN7Q9Y6W3 813 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 CENPEQ02224 2701 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 TEX15Q9BXT5 2789 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1B0GTH9 108 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PS29 197 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 PINLYPA6NC86 204 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 OR6C76A6NM76 312 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 FAM166BA8MTA8 275 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 CAPN14A8MX76 684 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 G3V2L1 256 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 PCDH7O60245 1069 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 PLIN3O60664 434 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 PROCP04070 461 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 ENO1P06733 434 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 TPOP07202 933 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 CPMP14384 443 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 CHN1P15882 459 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 SERPINB3P29508 390 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 GALNSP34059 522 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 PTGER1P34995 402 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 PTGS2P35354 604 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 PIGAP37287 484 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 DNASE1L1P49184 302 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 HTR6P50406 440 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 SMSP52788 366 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 SLC37A1P57057 533 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 NAA20P61599 178 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 PPIAP62937 165 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 KCNJ2P63252 427 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 HMGCS1Q01581 520 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 SPIN4Q56A73 249 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 FBXW10Q5XX13 1052 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 FAM180BQ6P0A1 224 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 SLC48A1Q6P1K1 146 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 MRGPRGQ86SM5 289 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 SLC22A16Q86VW1 577 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 SIAH3Q8IW03 269 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 MMP21Q8N119 569 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 EID3Q8N140 333 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 SLC15A4Q8N697 577 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
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PTPRM-214ENST00000583153 OR2M7Q8NG81 312 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 OR52N2Q8NGI0 321 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 OR2W6PQ8NHA6 318 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 C16orf52Q8NHV5 167 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 CDC26Q8NHZ8 85 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 RDH11Q8TC12 318 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 CHTF18Q8WVB6 975 aa7.69□□□□□ -1.18
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PTPRM-214ENST00000583153 APIPQ96GX9 242 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC120Q96HB5 630 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa7.69□□□□□ -1.18
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PTPRM-214ENST00000583153 CCT8L2Q96SF2 557 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 FAM173AQ9BQD7 235 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 ACPTQ9BZG2 426 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 WWTR1Q9GZV5 400 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 OR10A5Q9H207 317 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 GSTO2Q9H4Y5 243 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 EXO5Q9H790 373 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 CXorf21Q9HAI6 301 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 TMBIM4Q9HC24 238 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 DEPPQ9NTK1 212 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 MCM8Q9UJA3 840 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 MID2Q9UJV3 735 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 UTS2RQ9UKP6 389 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 EMCNQ9ULC0 261 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 CELSR2Q9HCU4 2923 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 PRSS44E7EML9 344 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 TP53I11O14683 189 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 IL3P08700 152 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 CT62P0C5K7 136 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 CCL3P10147 92 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 FOXA1P55317 472 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 NRG3P56975 720 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 DNAJB13P59910 316 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 HEPACAMQ14CZ8 416 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 EBPQ15125 230 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 AGBL2Q5U5Z8 902 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 PRAMEF20Q5VT98 475 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF787Q6DD87 383 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 RPTNQ6XPR3 784 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM64Q6YI46 380 aa7.68□□□□□ -1.18
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