RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575783.5

CTDNEP1-211, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-211ENST00000575783 DOC2AQ14183 400 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 CRYMQ14894 314 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 C18orf63Q68DL7 685 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 FRA10AC1Q70Z53 315 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 TP53INP1Q96A56 240 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 VPS39Q96JC1 886 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 PHACTR1Q9C0D0 580 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 ELOVL5Q9NYP7 299 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 LAMP3Q9UQV4 416 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 OARD1Q9Y530 152 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 A8MV72 311 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 PLAUP00749 431 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 TGFB1P01137 390 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 CLPSP04118 112 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 PGAM1P18669 254 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 KRT15P19012 456 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 SSTR4P31391 388 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 MAGEA3P43357 314 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 PCYT1AP49585 367 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 SIRPAP78324 504 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 SPRED3Q2MJR0 410 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 FBXO48Q5FWF7 155 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 FAM45BPQ6NSW5 357 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 SNX31Q8N9S9 440 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 FAM45AQ8TCE6 357 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 RHBDF1Q96CC6 855 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 KLHL4Q9C0H6 718 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 GPRC5BQ9NZH0 403 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 WIPF1O43516 503 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 FAM157CP0CG43 387 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 IDUAP35475 653 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 RPS13P62277 151 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 TSNQ15631 228 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 TMEM35AQ53FP2 167 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 DESI1Q6ICB0 168 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 SH2D5Q6ZV89 423 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 GPR180Q86V85 440 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 IFNEQ86WN2 208 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 ANKRD7Q92527 254 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 ESAMQ96AP7 390 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 CTHRC1Q96CG8 243 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 MS4A8Q9BY19 250 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 TSPY26PQ9H489 355 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 EHD1Q9H4M9 534 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 ACTR8Q9H981 624 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 GALNT9Q9HCQ5 603 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 DNAJC11Q9NVH1 559 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 MS4A12Q9NXJ0 267 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 TAS2R10Q9NYW0 307 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 ROS1P08922 2347 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 MED12Q93074 2177 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 LRRC14BA6NHZ5 514 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 GLOD5A6NK44 160 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 TMCC2O75069 709 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 ICOSLGO75144 302 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 CDH16O75309 829 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 CBR3O75828 277 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 GPR75O95800 540 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 CRHP06850 196 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 PCNAP12004 261 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 CD22P20273 847 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 ABCD3P28288 659 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 LHX2P50458 406 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 OCRLQ01968 901 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 FUT7Q11130 342 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 BEX5Q5H9J7 111 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 OR4C11Q6IEV9 310 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 OR2A2Q6IF42 318 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 AAGABQ6PD74 315 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 CHMP1BQ7LBR1 199 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 CNTN4Q8IWV2 1026 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF611Q8N823 705 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF610Q8N9Z0 462 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 EFCAB11Q9BUY7 163 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 C19orf24Q9BVV8 132 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 PSD3Q9NYI0 1048 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 HEY2Q9UBP5 337 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 ABCA1O95477 2261 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 SLC22A20A6NK97 555 aa14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms