RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		20.05	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		20.05	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC126	Q96EE4	140 aa		20.05	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF681	Q96N22	645 aa		20.05	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		20.05	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	HEY2	Q9UBP5	337 aa		20.05	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	MCM8	Q9UJA3	840 aa		20.05	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	TIMM22	Q9Y584	194 aa		20.05	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	SERTM1	A2A2V5	107 aa		20.04	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		20.04	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	20.04	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	TPO	P07202	933 aa		20.04	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	NT5E	P21589	574 aa		20.04	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	HTR1E	P28566	365 aa		20.04	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	HMOX2	P30519	316 aa		20.04	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	MAGEA5	P43359	124 aa		20.04	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	DUSP2	Q05923	314 aa		20.04	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP4K2	Q12851	820 aa		20.04	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	TAGAP	Q8N103	731 aa		20.04	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		20.04	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	20.04	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		20.04	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		20.04	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	CNIH4	Q9P003	139 aa		20.04	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF639	Q9UID6	485 aa		20.04	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	20.04	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		20.04	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	20.04	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1B0GVC2	190 aa		20.03	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	PLIN3	O60664	434 aa		20.03	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	CELA3A	P09093	270 aa		20.03	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	MYL2	P10916	166 aa		20.03	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	20.03	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	20.03	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	CCT5	P48643	541 aa		20.03	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXA1	P55317	472 aa		20.03	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	HMGCS1	Q01581	520 aa		20.03	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	DUSP8	Q13202	625 aa		20.03	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		20.03	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	PAOX	Q6QHF9	649 aa		20.03	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM64	Q6YI46	380 aa		20.03	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	EID3	Q8N140	333 aa		20.03	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		20.03	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM13C	Q8NE31	585 aa		20.03	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	MARVELD3	Q96A59	401 aa		20.03	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	20.03	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	APIP	Q96GX9	242 aa		20.03	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		20.03	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		20.03	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		20.03	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	20.03	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	FREM3	P0C091	2139 aa		20.03	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	20.02	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT15	P19012	456 aa		20.02	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	GPX3	P22352	226 aa		20.02	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	20.02	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAJB13	P59910	316 aa		20.02	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC153	Q494R4	210 aa		20.02	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	SPIN4	Q56A73	249 aa		20.02	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		20.02	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		20.02	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		20.02	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIL	Q7L0X0	811 aa		20.02	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		20.02	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		20.02	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		20.02	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		20.02	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	KLHL29	Q96CT2	875 aa		20.02	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	20.02	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		20.02	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	PSME2	Q9UL46	239 aa		20.02	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		20.02	■□□□□ 0.8
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		20.02	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		20.02	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	SMIM23	A6NLE4	172 aa		20.02	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDH7	O60245	1069 aa		20.02	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	CLDN14	O95500	239 aa		20.02	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		20.02	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	PRF1	P14222	555 aa		20.02	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	NAGLU	P54802	743 aa		20.02	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	NAA20	P61599	178 aa		20.02	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC18A2	Q05940	514 aa		20.02	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		20.02	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	20.02	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	20.02	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	20.02	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		20.02	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	CHST11	Q9NPF2	352 aa		20.02	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	OXSM	Q9NWU1	459 aa		20.02	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		20.02	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		20.02	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC151	A5D8V7	595 aa		20.01	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	OR14I1	A6ND48	311 aa		20.01	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	SUSD5	O60279	629 aa		20.01	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	CDH16	O75309	829 aa		20.01	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	CBX7	O95931	251 aa		20.01	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	IL3	P08700	152 aa		20.01	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	DRD2	P14416	443 aa		20.01	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT4	P19013	534 aa		20.01	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	ALDH9A1	P49189	494 aa		20.01	■□□□□ 0.79

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