RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	MCF2	P10911	925 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	GM2A	P17900	193 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SSTR1	P30872	391 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	STX2	P32856	288 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	AMT	P48728	403 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NOV	P48745	357 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	THOP1	P52888	689 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	DLX5	P56178	289 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	FGL1	Q08830	312 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MEF2D	Q14814	521 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	EFNB3	Q15768	340 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PARP6	Q2NL67	630 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	GPAT3	Q53EU6	434 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SHF	Q7M4L6	423 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ERAS	Q7Z444	233 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SCD5	Q86SK9	330 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	LUZP2	Q86TE4	346 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	M1AP	Q8TC57	530 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF128	Q8TEB7	428 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIB2	Q92519	343 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RFT1	Q96AA3	541 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	LGALS12	Q96DT0	336 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RTP4	Q96DX8	246 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MTBP	Q96DY7	904 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PRRC1	Q96M27	445 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NPAS2	Q99743	824 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MAP3K3	Q99759	626 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SMOX	Q9NWM0	555 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	IL20	Q9NYY1	176 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	HACD3	Q9P035	362 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	LHX3	Q9UBR4	397 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CDH9	Q9ULB4	789 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PADI3	Q9ULW8	664 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	IFT52	Q9Y366	437 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR45	Q9Y484	360 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP10D	Q9P241	1426 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PNV4	684 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC26	A0AVF1	554 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	PLSCR5	A0PG75	271 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	BTBD17	A6NE02	478 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957		C9JVG2	144 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	PDLIM1	O00151	329 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	BTN3A3	O00478	584 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	CCS	O14618	274 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	ARPC2	O15144	300 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC22A2	O15244	555 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	HSPA12A	O43301	675 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	ZSCAN12	O43309	604 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	AKR7A2	O43488	359 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	OR1F1	O43749	312 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	JAK2	O60674	1132 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAJB6	O75190	326 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	ANP32D	O95626	131 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	TSPAN12	O95859	305 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	TGM6	O95932	706 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	APOA1	P02647	267 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	OPN1LW	P04000	364 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	CPN1	P15169	458 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	B4GALT1	P15291	398 aa		2.52	□□□□□ -2.01

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