RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557640.1

RD3L-201, Transcript of retinal degeneration 3 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene RD3L, Length 1,201 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3L-201ENST00000557640 SORDQ00796 357 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 DR1Q01658 176 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 DUSP8Q13202 625 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 BMPR2Q13873 1038 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 CSHL1Q14406 222 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 ZNF460Q14592 562 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 CRYMQ14894 314 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 ADPRMQ3LIE5 342 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 FBXO48Q5FWF7 155 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 PIGGQ5H8A4 983 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 SHEQ5VZ18 495 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 FBXW10Q5XX13 1052 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 TMEM64Q6YI46 380 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 LACC1Q8IV20 430 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 OR14A16Q8NHC5 309 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 SIGLEC10Q96LC7 697 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 TIMP4Q99727 224 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 ERP44Q9BS26 406 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 TMEM79Q9BSE2 394 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 G6PC3Q9BUM1 346 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 CCDC68Q9H2F9 335 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 UBQLN3Q9H347 655 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 SAMD15Q9P1V8 674 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 DAPP1Q9UN19 280 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 SLC22A14Q9Y267 594 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 SNX24Q9Y343 169 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 TESMINQ9Y4I5 508 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 PCNX3Q9H6A9 2034 aa7.23□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 ESYT3A0FGR9 886 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 SH3D21A4FU49 640 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 PFDN6O15212 129 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 IFNA16P05015 189 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 RHOXF2BP0C7M4 288 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 BMP7P18075 431 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 TIMP3P35625 211 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 SLC6A12P48065 614 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 AP1S2P56377 157 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 SKP1P63208 163 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 KCNJ2P63252 427 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 CDK16Q00536 496 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 GPS1Q13098 491 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 BBS9Q3SYG4 887 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 EIPR1Q53HC9 387 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 TEX35Q5T0J7 233 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 NIPAL1Q6NVV3 410 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 ABHD17CQ6PCB6 329 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 OPN5Q6U736 354 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 LUZP2Q86TE4 346 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 IGDCC3Q8IVU1 814 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 OR4N5Q8IXE1 308 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 ZNF595Q8IYB9 648 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 NAT8LQ8N9F0 302 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 MORN4Q8NDC4 146 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 TRPV3Q8NET8 790 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 OR8K3Q8NH51 312 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 SLC44A1Q8WWI5 657 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 IGFBPL1Q8WX77 278 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 NTNG2Q96CW9 530 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 PERPQ96FX8 193 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 WDYHV1Q96HA8 205 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 MARK4Q96L34 752 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 SGCZQ96LD1 299 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 RUNDC3BQ96NL0 473 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 AIF1LQ9BQI0 150 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 RHOXF2Q9BQY4 288 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 UGT2B28Q9BY64 529 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 ACKR4Q9NPB9 350 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 VTI1BQ9UEU0 232 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 RAB21Q9UL25 225 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 DTX4Q9Y2E6 619 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 COMMD10Q9Y6G5 202 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RD3L-201ENST00000557640 WASHC1A8K0Z3 465 aa7.21□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 B4DXG7 233 aa7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms