RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GLI4P10075 376 aa17.91■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COX7A2P14406 83 aa17.91■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRT6CP48668 564 aa17.91■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DNAJB13P59910 316 aa17.91■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BIKQ13323 160 aa17.91■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF793Q6ZN11 406 aa17.91■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPR180Q86V85 440 aa17.91■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NUDT13Q86X67 352 aa17.91■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WDR20Q8TBZ3 569 aa17.91■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRPC4APQ8TEL6 797 aa17.91■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF721Q8TF20 911 aa17.91■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OXSMQ9NWU1 459 aa17.91■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRPS1Q9UHF7 1281 aa17.91■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF225Q9UK10 706 aa17.91■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ACAD8Q9UKU7 415 aa17.91■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LIPGQ9Y5X9 500 aa17.91■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ACTL7BQ9Y614 415 aa17.91■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A1B0GTL3 188 aa17.9■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa17.9■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPP6CO00743 305 aa17.9■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WDR1O75083 606 aa17.9■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATP6AP2O75787 350 aa17.9■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCL3P10147 92 aa17.9■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ETV4P43268 484 aa17.9■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DNASE1L1P49184 302 aa17.9■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAN2A2P49641 1150 aa17.9■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NEK2P51955 445 aa17.9■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDH13P55290 713 aa17.9■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PKNOX1P55347 436 aa17.9■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ID2Q02363 134 aa17.9■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYBPHQ13203 477 aa17.9■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SGO1Q5FBB7 561 aa17.9■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CFAP157Q5JU67 520 aa17.9■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa17.9■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NUBPLQ8TB37 319 aa17.9■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SELENOMQ8WWX9 145 aa17.9■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TANKQ92844 425 aa17.9■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SARAFQ96BY9 339 aa17.9■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF382Q96SR6 550 aa17.9■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LDAHQ9H6V9 325 aa17.9■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATG4BQ9Y4P1 393 aa17.9■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM215AQ9Y5M1 114 aa17.9■□□□□ 0.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ITPR3Q14573 2671 aa17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 H3BQF6 201 aa17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HCN1O60741 890 aa17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GUCY1B2O75343 617 aa17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPAG7O75391 227 aa17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ENO1P06733 434 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CPA3P15088 417 aa17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HMOX2P30519 316 aa17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STT3AP46977 705 aa17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TNFRSF17Q02223 184 aa17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ASPHQ12797 758 aa17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LCP2Q13094 533 aa17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PCLAFQ15004 111 aa17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WLSQ5T9L3 541 aa17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC22A10Q63ZE4 541 aa17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RTL6Q6ICC9 239 aa17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM200AQ86VY9 491 aa17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNF175Q8N4F7 328 aa17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC15A4Q8N697 577 aa17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCNYL1Q8N7R7 359 aa17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TCP10LQ8TDR4 215 aa17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DGAT2Q96PD7 388 aa17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GSTO2Q9H4Y5 243 aa17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BRF2Q9HAW0 419 aa17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC17A7Q9P2U7 560 aa17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADAM29Q9UKF5 820 aa17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC12A4Q9UP95 1085 aa17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa17.88■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A0G2JNJ9 132 aa17.88■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CRCPO75575 148 aa17.88■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZWINTO95229 277 aa17.88■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGKV3-11P04433 115 aa17.88■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CELA3AP09093 270 aa17.88■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM58BPP0C7Q3 252 aa17.88■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HSD3B1P14060 373 aa17.88■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TSPAN8P19075 237 aa17.88■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HSD3B2P26439 372 aa17.88■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ART1P52961 327 aa17.88■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LETMD1Q6P1Q0 360 aa17.88■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC22A8Q8TCC7 542 aa17.88■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM111AQ96PZ2 611 aa17.88■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SH2D2AQ9NP31 389 aa17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms