RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	TMEM233	B4DJY2	109 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	CHST10	O43529	356 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	SLC25A12	O75746	678 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	SCEL	O95171	688 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	BSG	P35613	385 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	RAP1GDS1	P52306	607 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	MTTP	P55157	894 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	GPR85	P60893	370 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	MEP1A	Q16819	746 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	ATG16L1	Q676U5	607 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	ARSK	Q6UWY0	536 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	SERINC2	Q96SA4	455 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	THAP1	Q9NVV9	213 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	SCN2A	Q99250	2005 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222		A0A0G2JNJ9	132 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	B3GALT2	O43825	422 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	NME2P1	O60361	137 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	ICAM2	P13598	275 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	NME2	P22392	152 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	CERS1	P27544	350 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	ADH7	P40394	386 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	SSR2	P43308	183 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	OLR1	P78380	273 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	RUNX2	Q13950	521 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	SULF2	Q8IWU5	870 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	METTL4	Q8N3J2	472 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	AGR3	Q8TD06	166 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222		Q9UFV3	132 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	STAB1	Q9NY15	2570 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222		A0A0A6YYD5	115 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	PINLYP	A6NC86	204 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	EED	O75530	441 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	CHEK2	O96017	543 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	C8B	P07358	591 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	IL10	P22301	178 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	XCR1	P46094	333 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	HMGCS1	Q01581	520 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	OCRL	Q01968	901 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	RTL6	Q6ICC9	239 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	CA13	Q8N1Q1	262 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	TSLP	Q969D9	159 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	PEX11G	Q96HA9	241 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	OR1F2P	Q96R84	312 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	LYRM4	Q9HD34	91 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	AHSP	Q9NZD4	102 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-231	ENST00000552222	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		12.79	□□□□□ -0.36

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