RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550375.1

BRF1-217, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 3

Gene BRF1, Length 1,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-217ENST00000550375 ZFAND5O76080 213 aa16■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 S1PR1P21453 382 aa16■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 GPC1P35052 558 aa16■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 SOX18P35713 384 aa16■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 ST13P50502 369 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 SLC37A1P57057 533 aa16■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 RNF4P78317 190 aa16■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 FUT7Q11130 342 aa16■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 LY6DQ14210 128 aa16■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 CRB2Q5IJ48 1285 aa16■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 SPANXN4Q5MJ08 99 aa16■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 H3F3CQ6NXT2 135 aa16■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 PAOXQ6QHF9 649 aa16■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 TMEM107Q6UX40 140 aa16■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 SLC5A8Q8N695 610 aa16■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 ZNF675Q8TD23 568 aa16■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 OR10A5Q9H207 317 aa16■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 RABEP2Q9H5N1 569 aa16■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 CDCP1Q9H5V8 836 aa16■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 CLMPQ9H6B4 373 aa16■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 KLHL14Q9P2G3 628 aa16■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 GMNCA6NCL1 334 aa15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 PDGFAP04085 211 aa15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 ALPPP05187 535 aa15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 S100A3P33764 101 aa15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 SOX11P35716 441 aa15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 MC3RP41968 323 aa15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 FRKP42685 505 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 KIR3DL1P43629 444 aa15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 DGKQP52824 942 aa15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 TCTN3Q6NUS6 607 aa15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 PCSK4Q6UW60 755 aa15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 ISLR2Q6UXK2 745 aa15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 C9orf40Q8IXQ3 194 aa15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 OR7G2Q8NG99 324 aa15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 OR52R1Q8NGF1 315 aa15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 OR9I1Q8NGQ6 314 aa15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 STON2Q8WXE9 905 aa15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 TESCQ96BS2 214 aa15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 CTHRC1Q96CG8 243 aa15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 ZNF354BQ96LW1 612 aa15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 GAL3ST4Q96RP7 486 aa15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 NPAS2Q99743 824 aa15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 ADNPQ9H2P0 1102 aa15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 ZIM2Q9NZV7 527 aa15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 ZNF639Q9UID6 485 aa15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 TRIM33Q9UPN9 1127 aa15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 CFLARO15519 480 aa15.98■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 NME6O75414 186 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 C6orf47O95873 294 aa15.98■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 CBX7O95931 251 aa15.98■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 F10P00742 488 aa15.98■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 DRD4P21917 467 aa15.98■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 GPX3P22352 226 aa15.98■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 CDK9P50750 372 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 WNT3P56703 355 aa15.98■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 PHC1P78364 1004 aa15.98■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 DUSP8Q13202 625 aa15.98■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 MEP1AQ16819 746 aa15.98■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 ACER2Q5QJU3 275 aa15.98■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 ABHD17BQ5VST6 288 aa15.98■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 SLC29A4Q7RTT9 530 aa15.98■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 CAMKMTQ7Z624 323 aa15.98■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 CPLX4Q7Z7G2 160 aa15.98■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 ZNF615Q8N8J6 731 aa15.98■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 OR7G1Q8NGA0 311 aa15.98■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 OR8J2Q8NGG1 315 aa15.98■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 PLA2G3Q9NZ20 509 aa15.98■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 STMN3Q9NZ72 180 aa15.98■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 TEKT2Q9UIF3 430 aa15.98■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 ATMQ13315 3056 aa15.97■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 WWP2O00308 870 aa15.97■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 MLF1P58340 268 aa15.97■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 MFAP5Q13361 173 aa15.97■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 SQLEQ14534 574 aa15.97■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 DPY19L1Q2PZI1 675 aa15.97■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 FHL5Q5TD97 284 aa15.97■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 ASB18Q6ZVZ8 466 aa15.97■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 ANKRD46Q86W74 232 aa15.97■□□□□ 0.15
BRF1-217ENST00000550375 CLECL1Q8IZS7 167 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms