RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 AMDHD1Q96NU7 426 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 ARMC1Q9NVT9 282 aa8.1□□□□□ -1.11
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PTPRB-208ENST00000550358 ALG5Q9Y673 324 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 DENRO43583 198 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 RPS17P08708 135 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
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PTPRB-208ENST00000550358 MOGSQ13724 837 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.1□□□□□ -1.11
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PTPRB-208ENST00000550358 TREML1Q86YW5 311 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 KLHDC9Q8NEP7 349 aa8.1□□□□□ -1.11
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PTPRB-208ENST00000550358 SMURF1Q9HCE7 757 aa8.1□□□□□ -1.11
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PTPRB-208ENST00000550358 A0A0G2JN53 185 aa8.1□□□□□ -1.11
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PTPRB-208ENST00000550358 SCN7AQ01118 1682 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 S100A6P06703 90 aa8.1□□□□□ -1.11
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PTPRB-208ENST00000550358 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
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PTPRB-208ENST00000550358 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
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PTPRB-208ENST00000550358 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 IGDCC3Q8IVU1 814 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC116Q8IYX3 515 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 IL22RA1Q8N6P7 574 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 HTRA1Q92743 480 aa8.09□□□□□ -1.11
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