RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544662.1

PUS1-211, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene PUS1, Length 836 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-211ENST00000544662 C2orf80Q0P641 193 aa20.18■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 LTB4RQ15722 352 aa20.18■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 C1QL3Q5VWW1 255 aa20.18■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 RNF165Q6ZSG1 346 aa20.18■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 OR2M7Q8NG81 312 aa20.18■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 OR2T11Q8NH01 316 aa20.18■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 TP53INP1Q96A56 240 aa20.18■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa20.18■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 LRTM1Q9HBL6 345 aa20.18■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 MYNNQ9NPC7 610 aa20.18■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 SACM1LQ9NTJ5 587 aa20.18■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 EHD3Q9NZN3 535 aa20.18■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 ZNF639Q9UID6 485 aa20.18■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 TRAF6Q9Y4K3 522 aa20.18■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 NPIPB8E9PQR5 432 aa20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 TFECO14948 347 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 LINC00032P0C843 101 aa20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 CCL3P10147 92 aa20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 DDCP20711 480 aa20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 CNR1P21554 472 aa20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 ARRB2P32121 409 aa20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 RBPJQ06330 500 aa20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 DUSP8Q13202 625 aa20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 KIAA0040Q15053 153 aa20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 FAM71E1Q6IPT2 247 aa20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 NOXRED1Q6NXP6 359 aa20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 LRIG3Q6UXM1 1119 aa20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 Q6ZSR9 355 aa20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 CROCCP2Q86T23 111 aa20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 CCDC116Q8IYX3 515 aa20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 CLYBLQ8N0X4 340 aa20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 TAGAPQ8N103 731 aa20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 SIMC1Q8NDZ2 872 aa20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 C16orf52Q8NHV5 167 aa20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 ADIPOR1Q96A54 375 aa20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 CTHRC1Q96CG8 243 aa20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 GIMAP4Q9NUV9 329 aa20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 C1orf109Q9NX04 203 aa20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 BCAP29Q9UHQ4 241 aa20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 ENTPD4Q9Y227 616 aa20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 LRRK2Q5S007 2527 aa20.17■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 A0A1B0GUH1 482 aa20.16■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 WIPF3A6NGB9 483 aa20.16■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 ERLIN1O75477 346 aa20.16■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 P04436 131 aa20.16■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 FBXO45P0C2W1 286 aa20.16■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 NEFHP12036 1026 aa20.16■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 PCSK2P16519 638 aa20.16■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 GPX3P22352 226 aa20.16■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 SERPINB5P36952 375 aa20.16■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 SERPINB4P48594 390 aa20.16■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 PRSS53Q2L4Q9 553 aa20.16■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 UGT3A2Q3SY77 523 aa20.16■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 SH2D4BQ5SQS7 431 aa20.16■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 TMEM64Q6YI46 380 aa20.16■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 NUDCD3Q8IVD9 361 aa20.16■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 FAM13CQ8NE31 585 aa20.16■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 OR6Y1Q8NGX8 325 aa20.16■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 AGR3Q8TD06 166 aa20.16■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 ZNF675Q8TD23 568 aa20.16■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 TWIST2Q8WVJ9 160 aa20.16■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 PGM2Q96G03 612 aa20.16■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 PKNOX2Q96KN3 472 aa20.16■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 FAM173AQ9BQD7 235 aa20.16■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 SH2D2AQ9NP31 389 aa20.16■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 DTX4Q9Y2E6 619 aa20.16■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa20.15■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 HS6ST1O60243 411 aa20.15■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 CBX7O95931 251 aa20.15■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 HSF1Q00613 529 aa20.15■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 CEBPEQ15744 281 aa20.15■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 ZNF628Q5EBL2 1059 aa20.15■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 SLC22A10Q63ZE4 541 aa20.15■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 FAM47EQ6ZV65 393 aa20.15■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 FJX1Q86VR8 437 aa20.15■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 TICAM1Q8IUC6 712 aa20.15■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 HOMEZQ8IX15 550 aa20.15■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 DDIASQ8IXT1 998 aa20.15■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 GHDCQ8N2G8 530 aa20.15■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 OR9A2Q8NGT5 310 aa20.15■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 PAQR8Q8TEZ7 354 aa20.15■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 RELTQ969Z4 430 aa20.15■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 MIEF1Q9NQG6 463 aa20.15■□□□□ 0.82
PUS1-211ENST00000544662 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.5 ms