RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531967.5

ECHDC1-222, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ECHDC1, Length 2,585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-222	ENST00000531967	ETS2	P15036	469 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	CNR1	P21554	472 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	P2RY2	P41231	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	CSNK1D	P48730	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLC9A3	P48764	834 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	LIMK2	P53671	638 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	KCNK10	P57789	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLC3A1	Q07837	685 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	NME3	Q13232	169 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	VEZF1	Q14119	521 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SYPL1	Q16563	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	TDH	Q8IZJ6	230 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	TEX26	Q8N6G2	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SNAPC3	Q92966	411 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	OTUB2	Q96DC9	234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	GFI1	Q99684	422 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	MED10	Q9BTT4	135 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	TMEM202	A6NGA9	273 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	HHLA1	C9JL84	531 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967		M0QZ24	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	LDB3	O75112	727 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	LRCH4	O75427	683 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	BAG3	O95817	575 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	ITGB2	P05107	769 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	CTRB1	P17538	263 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	FBLN1	P23142	703 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	CYP2J2	P51589	502 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	ITGAD	Q13349	1161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SPCS2	Q15005	226 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	VAMP3	Q15836	100 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	CYP1B1	Q16678	543 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	ESCO2	Q56NI9	601 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	RGMB	Q6NW40	437 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	RPTN	Q6XPR3	784 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	ARC	Q7LC44	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	FAM122B	Q7Z309	247 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	NLRX1	Q86UT6	975 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	GTF2H4	Q92759	462 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR10A2	Q9H208	303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967		Q9N2K0	584 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	HCST	Q9UBK5	93 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	PLLP	Q9Y342	182 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	MAP3K5	Q99683	1374 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	GRIN2D	O15399	1336 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SHPRH	Q149N8	1683 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967		A0A0A6YYH2	397 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967		A0A1B0GW15	77 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967		A6NJ64	397 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967		E7ESA3	106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	CYP26A1	O43174	497 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	GPX5	O75715	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	ATP6AP2	O75787	350 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	BRI3	O95415	125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	PIGR	P01833	764 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	IL6	P05231	212 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	SERPINE2	P07093	398 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-222	ENST00000531967	FURIN	P09958	794 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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