RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 RAPSNQ13702 412 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 GRB7Q14451 532 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 TBRG1Q3YBR2 411 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 C1orf189Q5VU69 101 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 TTC23LQ6PF05 361 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 LINC01555Q8NAE3 123 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 OR4L1Q8NH43 312 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 FAR1Q8WVX9 515 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 PANX3Q96QZ0 392 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 NRTNQ99748 197 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 MECRQ9BV79 373 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 TRIM2Q9C040 744 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 CUTCQ9NTM9 273 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 IRAK4Q9NWZ3 460 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 LUZP4Q9P127 313 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ENTPD4Q9Y227 616 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 PRSS21Q9Y6M0 314 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 FAM169AQ9Y6X4 670 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 POLQO75417 2590 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 A0A1B0GUH1 482 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC162PA2VCL2 907 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 HPP00738 406 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 ENO1P06733 434 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 STSP08842 583 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 PRR35P0CG20 571 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 PRSS56P0CW18 603 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 IGFBP2P18065 325 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 CCR7P32248 378 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 GRK5P34947 590 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 IDUAP35475 653 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 TAS2R50P59544 299 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 PRAMEP78395 509 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 RELAQ04206 551 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 HSPA14Q0VDF9 509 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 MFAP5Q13361 173 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 OASLQ15646 514 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 RBBP7Q16576 425 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 ISLR2Q6UXK2 745 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF534Q76KX8 674 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 COX15Q7KZN9 410 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 PEX26Q7Z412 305 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 KCNMB4Q86W47 210 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 UEVLDQ8IX04 471 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 BCORP1Q8N888 145 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 DNAAF3Q8N9W5 541 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 OR11G2Q8NGC1 345 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 MAGEC3Q8TD91 643 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 RAD51AP1Q96B01 352 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 HES6Q96HZ4 224 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 SELENOSQ9BQE4 189 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM121Q9BTD3 319 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 P2RY12Q9H244 342 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 C14orf105Q9NVL8 296 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 SPATA7Q9P0W8 599 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 KLHL13Q9P2N7 655 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 ANAPC5Q9UJX4 755 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 SLC12A4Q9UP95 1085 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 NTNG1Q9Y2I2 539 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 MTORP42345 2549 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 ANKRD12Q6UB98 2062 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 TRAV17A0A0B4J275 112 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 OR2A25A4D2G3 310 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 OR51F1A6NGY5 319 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 H3BMM5 538 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 MAP2K7O14733 419 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 OR1I1O60431 355 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 VPS26AO75436 327 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 GOT2P00505 430 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 PLAUP00749 431 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 ERGP11308 486 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 TNFRSF8P28908 595 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 ADARP55265 1226 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 FOXL2P58012 376 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-222ENST00000514552 ARHGAP19Q14CB8 494 aa6.38□□□□□ -1.39
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