RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514387.6

GPBP1-208, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 3,310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-208ENST00000514387 SLC25A30Q5SVS4 291 aa8.4□□□□□ -1.06
GPBP1-208ENST00000514387 OVOS1Q6IE37 1185 aa8.4□□□□□ -1.06
GPBP1-208ENST00000514387 SLC25A25Q6KCM7 469 aa8.4□□□□□ -1.06
GPBP1-208ENST00000514387 CNIH2Q6PI25 160 aa8.4□□□□□ -1.06
GPBP1-208ENST00000514387 METTL7BQ6UX53 244 aa8.4□□□□□ -1.06
GPBP1-208ENST00000514387 ANKRD46Q86W74 232 aa8.4□□□□□ -1.06
GPBP1-208ENST00000514387 PHACTR4Q8IZ21 702 aa8.4□□□□□ -1.06
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF321PQ8N8H1 164 aa8.4□□□□□ -1.06
GPBP1-208ENST00000514387 REPS2Q8NFH8 660 aa8.4□□□□□ -1.06
GPBP1-208ENST00000514387 OR4L1Q8NH43 312 aa8.4□□□□□ -1.06
GPBP1-208ENST00000514387 SGCZQ96LD1 299 aa8.4□□□□□ -1.06
GPBP1-208ENST00000514387 COQ10AQ96MF6 247 aa8.4□□□□□ -1.06
GPBP1-208ENST00000514387 LINC00052Q96N35 136 aa8.4□□□□□ -1.06
GPBP1-208ENST00000514387 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
GPBP1-208ENST00000514387 SOX7Q9BT81 388 aa8.4□□□□□ -1.06
GPBP1-208ENST00000514387 DOHHQ9BU89 302 aa8.4□□□□□ -1.06
GPBP1-208ENST00000514387 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa8.4□□□□□ -1.06
GPBP1-208ENST00000514387 ACTR10Q9NZ32 417 aa8.4□□□□□ -1.06
GPBP1-208ENST00000514387 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
GPBP1-208ENST00000514387 CPA4Q9UI42 421 aa8.4□□□□□ -1.06
GPBP1-208ENST00000514387 POMT2Q9UKY4 750 aa8.4□□□□□ -1.06
GPBP1-208ENST00000514387 OGDHLQ9ULD0 1010 aa8.4□□□□□ -1.06
GPBP1-208ENST00000514387 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa8.4□□□□□ -1.06
GPBP1-208ENST00000514387 SLC22A23A1A5C7 686 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 MOXD2PA6NHM9 499 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 ANKDD1BA6NHY2 528 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 H7C0S8 307 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 J3KR12 359 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 LDB2O43679 373 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 HBP1O60381 514 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 KCNK5O95279 499 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 MPC2O95563 127 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 OR4E1P0C645 316 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 JUPP14923 745 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 PIK3CGP48736 1102 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 TGM4P49221 684 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF81P51508 661 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 CRISP3P54108 245 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 TPBGQ13641 420 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 OCLNQ16625 522 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 DUOXA1Q1HG43 343 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 XKR4Q5GH76 650 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 NOMO2Q5JPE7 1267 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 WDR73Q6P4I2 378 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 PAQR3Q6TCH7 311 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 SCIMPQ6UWF3 145 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 PTCHD4Q6ZW05 846 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 LRRTM4Q86VH4 590 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 ASB12Q8WXK4 309 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 OSMRQ99650 979 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 OTOFQ9HC10 1997 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 LOC285556D6RIA3 1793 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 A0A1W2PPC1 479 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 SMLR1H3BR10 107 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 SGCEO43556 437 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 POP7O75817 140 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 AP2A2O94973 939 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 RAB3DO95716 219 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 GNG10P50151 68 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 CCR9P51686 369 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 NUDT6P53370 316 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 IL2P60568 153 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 RPS14P62263 151 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 MTAPQ13126 283 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 DNLZQ5SXM8 178 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 QSOX2Q6ZRP7 698 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 SYNPOQ8N3V7 929 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 OR1M1Q8NGA1 313 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 OR8D4Q8NGM9 314 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 RIT1Q92963 219 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 NECTIN4Q96NY8 510 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 TCEAL7Q9BRU2 100 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 H2AFJQ9BTM1 129 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 DDIT4Q9NX09 232 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 FTSJ1Q9UET6 329 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF222Q9UK12 451 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM88BA6NKF7 163 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 K7ERQ8 282 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 PRAF2O60831 178 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 FHP07954 510 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 ITPKAP23677 461 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 APEX1P27695 318 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 SLC6A4P31645 630 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 PCGF2P35227 344 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 IRS1P35568 1242 aa8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms