RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514110.5

SNHG4-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 4, human

TSL 1 (best)

Gene SNHG4, Length 679 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG4-208	ENST00000514110	CTAG2	O75638	210 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	TRAPPC6A	O75865	159 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	HPN	P05981	417 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	CD1E	P15812	388 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	S1PR1	P21453	382 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	UQCRC1	P31930	480 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	CASP3	P42574	277 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	MAGEA12	P43365	314 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	XK	P51811	444 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	IST1	P53990	364 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	HSPB2	Q16082	182 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	FRG2	Q64ET8	278 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	MMP21	Q8N119	569 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	NTNG2	Q96CW9	530 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	GNRHR2	Q96P88	292 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	FRG2B	Q96QU4	278 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	NTMT1	Q9BV86	223 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	UBQLN3	Q9H347	655 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	LIME1	Q9H400	295 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	PCTP	Q9UKL6	214 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	NF1	P21359	2839 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	AHRR	A9YTQ3	701 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	SYT5	O00445	386 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	STX16	O14662	325 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	SNX4	O95219	450 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	EPPIN	O95925	133 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	RBP1	P09455	135 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	CPM	P14384	443 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	NT5E	P21589	574 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	BMP5	P22003	454 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	GPX3	P22352	226 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	PHB	P35232	272 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	KIR2DL3	P43628	341 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	MASP1	P48740	699 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	MGAT2	Q10469	447 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	SGO1	Q5FBB7	561 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	DCST1	Q5T197	706 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	VASN	Q6EMK4	673 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	DESI1	Q6ICB0	168 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	C8orf74	Q6P047	294 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	PACS2	Q86VP3	889 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	METTL4	Q8N3J2	472 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	ISL2	Q96A47	359 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	SH3GL2	Q99962	352 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	XPR1	Q9UBH6	696 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	FREM3	P0C091	2139 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	SPG11	Q96JI7	2443 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	FAM221A	A4D161	298 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	PPP6C	O00743	305 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	DVL2	O14641	736 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	GNB5	O14775	395 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	SMIM24	O75264	130 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	ABCD3	P28288	659 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	TIMP3	P35625	211 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	SOX18	P35713	384 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	ASCL1	P50553	236 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF136	P52737	540 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	NRG3	P56975	720 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	DUSP2	Q05923	314 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	IFT88	Q13099	833 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	NNAT	Q16517	81 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG4-208	ENST00000514110	EIPR1	Q53HC9	387 aa		11.16	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms