RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 TCP11X1B4DZS4 312 aa24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 PLOD3O60568 738 aa24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 EDF1O60869 148 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 WDPCPO95876 746 aa24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 IDO1P14902 403 aa24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 FRKP42685 505 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 MGAT2Q10469 447 aa24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 MLC1Q15049 377 aa24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 GSTA3Q16772 222 aa24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 FCRLBQ6BAA4 426 aa24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 RIMKLAQ8IXN7 391 aa24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF321PQ8N8H1 164 aa24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF615Q8N8J6 731 aa24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 C17orf47Q8NEP4 570 aa24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 TP53INP1Q96A56 240 aa24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 COQ8BQ96D53 544 aa24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
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SH3BP2-212ENST00000508338 TRAV17A0A0B4J275 112 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 GOLGA8OA6NCC3 632 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 GOLGA8NF8WBI6 632 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 HRKO00198 91 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 PLOD2O00469 737 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 ITGA10O75578 1167 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 CT62P0C5K7 136 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 SSR4P51571 173 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 DIO3P55073 304 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 DCAF7P61962 342 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 PSPHP78330 225 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 DUSP2Q05923 314 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 RPS6KA2Q15349 733 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM180BQ6P0A1 224 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 MAVSQ7Z434 540 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 C9orf40Q8IXQ3 194 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM156Q8N614 296 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 ADCY4Q8NFM4 1077 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 OR9A2Q8NGT5 310 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC22A8Q8TCC7 542 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 NPAS2Q99743 824 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC28BQ9BUN5 200 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 GLIPR2Q9H4G4 154 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 BCAP29Q9UHQ4 241 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-212ENST00000508338 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa24.89■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 COQ9O75208 318 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 S1PR1P21453 382 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 SSTR4P31391 388 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 CYB561P49447 251 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 TNFSF10P50591 281 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 HLCSP50747 726 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 MANFP55145 182 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 EBPQ15125 230 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 TESCQ96BS2 214 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 WWTR1Q9GZV5 400 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.571e-6■■■■□ 22.9
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SH3BP2-212ENST00000508338 TAS2R9Q9NYW1 312 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 CLPSP04118 112 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 MDH1P40925 334 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 AQP5P55064 265 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 TUBA3CQ13748 450 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 LTB4RQ15722 352 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC6A19Q695T7 634 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 TUBA3EQ6PEY2 450 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM111BQ6SJ93 734 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 OPN5Q6U736 354 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 TAGAPQ8N103 731 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 AMER2Q8N7J2 671 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 OR7A2PQ8NGA2 310 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 ZBTB18Q99592 522 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM200CA6NKL6 621 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 UBDO15205 165 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 OR2J2O76002 312 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 GPC1P35052 558 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 PRSS53Q2L4Q9 553 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF385BQ569K4 471 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 PIGGQ5H8A4 983 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 VPS37AQ8NEZ2 397 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-212ENST00000508338 OR52R1Q8NGF1 315 aa24.86■■□□□ 1.57
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