RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492034.1

POLR1A-209, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 4

Gene POLR1A, Length 588 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-209ENST00000492034 DUSP2Q05923 314 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 SCARB2Q14108 478 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 ERV3-1Q14264 604 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 SYT16Q17RD7 645 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 ZNF628Q5EBL2 1059 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 MFSD4BQ5TF39 518 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 STPG1Q5TH74 334 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 C1orf189Q5VU69 101 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 PIP4P1Q86T03 277 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 GALNT12Q8IXK2 581 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 BMPERQ8N8U9 685 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 ADCY4Q8NFM4 1077 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 KAT2AQ92830 837 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 RIT1Q92963 219 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 LRFN5Q96NI6 719 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 PTCHD1Q96NR3 888 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 DEPDC7Q96QD5 511 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 ACTRT3Q9BYD9 372 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 RBCK1Q9BYM8 510 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 PARD6AQ9NPB6 346 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 EXD2Q9NVH0 621 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 ADPRHL2Q9NX46 363 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 SLC39A1Q9NY26 324 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 CALML5Q9NZT1 146 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 LIPT1Q9Y234 373 aa13.06□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 TCRBV5S2A0A599 114 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 TTC36A6NLP5 189 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 ALBP02768 609 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 IFNA16P05015 189 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 CD63P08962 238 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 TNNI3P19429 210 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 BTG2P78543 158 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 LTB4RQ15722 352 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 MINDY4Q4G0A6 757 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 CCDC157Q569K6 752 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 DCAF12Q5T6F0 453 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 CDCP2Q5VXM1 449 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 REEP3Q6NUK4 255 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 CCDC80Q76M96 950 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 OVCH1Q7RTY7 1134 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 LGI4Q8N135 537 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 C10orf111Q8N326 155 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 VWA5B2Q8N398 1253 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 HORMAD2Q8N7B1 307 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 OR7G2Q8NG99 324 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 NETO1Q8TDF5 533 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 ADAMTS15Q8TE58 950 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 CANT1Q8WVQ1 401 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 XAGE5Q8WWM1 108 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 LZICQ8WZA0 190 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 FKBP10Q96AY3 582 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 CTHRC1Q96CG8 243 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 VCX3BQ9H321 246 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 OR51I1Q9H343 314 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 MAGIXQ9H6Y5 334 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 CXorf21Q9HAI6 301 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 LANCL2Q9NS86 450 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 AURKCQ9UQB9 309 aa13.05□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 A0A1W2PS29 197 aa13.04□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 PROB1E7EW31 1015 aa13.04□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 HMGN4O00479 90 aa13.04□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 MT-CO3P00414 261 aa13.04□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 SERPINA1P01009 418 aa13.04□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 NUDT7P0C024 238 aa13.04□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 TFPTP0C1Z6 253 aa13.04□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 RAP2AP10114 183 aa13.04□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 NR2F1P10589 423 aa13.04□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 TGM1P22735 817 aa13.04□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 RORAP35398 523 aa13.04□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 GCKP35557 465 aa13.04□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 CLCN2P51788 898 aa13.04□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 LIMK1P53667 647 aa13.04□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 ISXQ2M1V0 245 aa13.04□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 CRB2Q5IJ48 1285 aa13.04□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 TBCELQ5QJ74 424 aa13.04□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 CDC73Q6P1J9 531 aa13.04□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 FKBP9P1Q75LS8 142 aa13.04□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 KRT73Q86Y46 540 aa13.04□□□□□ -0.32
POLR1A-209ENST00000492034 ADGRG5Q8IZF4 528 aa13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms