RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 ABCC4O15439 1325 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 A0A087WZY1 265 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 RNF212BA8MTL3 300 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 E9PMD0 336 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 SGK494L7N484 410 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 VPS26AO75436 327 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 STK17BO94768 372 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 DIRAS3O95661 229 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 ZCCHC18P0CG32 403 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 IL4RP24394 825 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 CALML3P27482 149 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 MDH1P40925 334 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 ITPK1Q13572 414 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 PARP6Q2NL67 630 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 FAM131BQ86XD5 332 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF781Q8N8C0 355 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 OR4F5Q8NH21 305 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 GIPC3Q8TF64 312 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC15Q8TF66 581 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 SLC45A3Q96JT2 553 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 TSPAN18Q96SJ8 248 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 CPXM1Q96SM3 734 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 ACTR8Q9H981 624 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 RARRES3Q9UL19 164 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 AUP1Q9Y679 476 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 SYNJ2O15056 1496 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0A6YYD4 124 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 ASB14A6NK59 587 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 SNAP91O60641 907 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 PEX11AO75192 247 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFA7O95182 113 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 AK1P00568 194 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 KRT6BP04259 564 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 KIF5BP33176 963 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 KRT6CP48668 564 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 KLHL30Q0D2K2 578 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 FUT7Q11130 342 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 LRIT3Q3SXY7 679 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 RNF130Q86XS8 419 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 AGAP3Q96P47 875 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 SYT11Q9BT88 431 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 YAE1D1Q9NRH1 226 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 STARD5Q9NSY2 213 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 ASIC3Q9UHC3 531 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 CUX2O14529 1486 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 NPIPA5E9PKD4 350 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 PDHXO00330 501 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 PDXKO00764 312 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 CYB561D2O14569 222 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 EI24O14681 340 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 CPLX1O14810 134 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 TNNI3P19429 210 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 SGSHP51688 502 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 GSTO1P78417 241 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 POM121L1PQ3SYA9 428 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 C2CD6Q53TS8 623 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF613Q6PF04 617 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 PAQR9Q6ZVX9 377 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 LUZP1Q86V48 1076 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 LMNTD2Q8IXW0 634 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 Q8NBF4 154 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 PRSS33Q8NF86 280 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 NPRL2Q8WTW4 380 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 NABP1Q96AH0 204 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 COQ10BQ9H8M1 238 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 GTSE1Q9NYZ3 720 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 P2RX2Q9UBL9 471 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 FKBP7Q9Y680 259 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 DCXO43602 365 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 HPRP00739 348 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 IGHG1P01857 330 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 SLC35G4P0C7Q5 338 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-212ENST00000491302 FOSL2P15408 326 aa6.34□□□□□ -1.39
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