RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 SLC46A2Q9BY10 475 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 BRD9Q9H8M2 597 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 NUDT15Q9NV35 164 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 FTSJ1Q9UET6 329 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ATP6V1HQ9UI12 483 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ACSL6Q9UKU0 697 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 DENND4CQ5VZ89 1909 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 DNAH14Q0VDD8 3507 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 PIPSLA2A3N6 862 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 MGAT4DA6NG13 374 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 GABRR3A8MPY1 467 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 IFNA16P05015 189 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 CD22P20273 847 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 HIST1H2ADP20671 130 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 PCGF2P35227 344 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ETV5P41161 510 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ETV1P50549 477 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 SMSP52788 366 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 EPHA5P54756 1037 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 DCDC1P59894 354 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 CHIT1Q13231 466 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 HEPACAMQ14CZ8 416 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 MPPE1Q53F39 396 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 SLAIN1Q8ND83 568 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 HIST1H2AJQ99878 128 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 H2AFJQ9BTM1 129 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ABCG5Q9H222 651 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 TRBC2A0A5B9 178 aa12.77□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 PIPP12273 146 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 CCSMST1Q4G0I0 132 aa12.77□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 CCNJQ5T5M9 372 aa12.77□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 MEDAGQ5VYS4 303 aa12.77□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 CHTF18Q8WVB6 975 aa12.77□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ASB11Q8WXH4 323 aa12.77□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 ECHDC3Q96DC8 303 aa12.77□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 LMLNQ96KR4 655 aa12.77□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 LYSMD1Q96S90 227 aa12.77□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 TMED9Q9BVK6 235 aa12.77□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 LIN7BQ9HAP6 207 aa12.77□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 SLC25A19Q9HC21 320 aa12.77□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 SPATA2Q9UM82 520 aa12.77□□□□□ -0.36
NISCH-212ENST00000488380 PAHP00439 452 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 HRGP04196 525 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 FCER2P06734 321 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 TPOP07202 933 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 NAT2P11245 290 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 ANXA3P12429 323 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 CSNK1DP48730 415 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 XKP51811 444 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 TMEM81Q6P7N7 255 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 LIPIQ6XZB0 460 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 NPAS3Q8IXF0 933 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 LAS2Q8IYD9 372 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 FBXW5Q969U6 566 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 OTULINQ96BN8 352 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 RBCK1Q9BYM8 510 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 VPS29Q9UBQ0 182 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 HCN2Q9UL51 889 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 SPINT3P49223 89 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 EVX1P49640 407 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 IRF8Q02556 426 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 GPR176Q14439 515 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 SHFQ7M4L6 423 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 CREB3L1Q96BA8 519 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 HHIPL1Q96JK4 782 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 SLC12A9Q9BXP2 914 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 BEX1Q9HBH7 125 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 CORO2BQ9UQ03 480 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 TOR1AO14656 332 aa12.76□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 IFNW1P05000 195 aa12.76□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 CXCL3P19876 107 aa12.76□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 NNMTP40261 264 aa12.76□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 MAPK8P45983 427 aa12.76□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 SLC6A12P48065 614 aa12.76□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 GCNT6Q5T4J0 391 aa12.76□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa12.76□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 GHDCQ8N2G8 530 aa12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms