RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487147.5

COL6A4P1-202, Transcript of collagen type VI alpha 4 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene COL6A4P1, Length 4,317 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A4P1-202ENST00000487147 MPPE1Q53F39 396 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 SNX33Q8WV41 574 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 TBC1D20Q96BZ9 403 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 ARMC5Q96C12 935 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 ZSWIM3Q96MP5 696 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 TBC1D24Q9ULP9 559 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 RIIAD1A6NNX1 92 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 FAM25EA8MYX2 175 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 J3QLW9 94 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 TNFRSF10BO14763 440 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 MMP20O60882 483 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 KLHL18O94889 574 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 EOMESO95936 686 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 ACPPP15309 386 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 ZNF19P17023 458 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 CCR7P32248 378 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 PITPNBP48739 271 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 MC1RQ01726 317 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 TEKQ02763 1124 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 TGM3Q08188 693 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 ST3GAL3Q11203 375 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 PTOV1Q86YD1 416 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 TCTE3Q8IZS6 198 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 FBXO22Q8NEZ5 403 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 BEST4Q8NFU0 473 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 RAET1EQ8TD07 263 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 SOCS4Q8WXH5 440 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 SCAMP4Q969E2 229 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 PTPN18Q99952 460 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 P2RY13Q9BPV8 354 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 CFAP97Q9P2B7 532 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 H7C0S8 307 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 COCHO43405 550 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 NCR1O76036 304 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 PLATP00750 562 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 IFNGP01579 166 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 EPHX1P07099 455 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 OR12D1P0DN82 309 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 OMPP47874 163 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 GIPRP48546 466 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 CTBP2P56545 445 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 RAB40BQ12829 278 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 GRB14Q14449 540 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 CCL14Q16627 93 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 GGTA1PQ4G0N0 100 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 YIF1BQ5BJH7 314 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 TOR2AQ5JU69 321 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 GRHL2Q6ISB3 625 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 LAIR2Q6ISS4 152 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 PYHIN1Q6K0P9 492 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 C6orf120Q7Z4R8 191 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 CEACAM19Q7Z692 300 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 KLHDC9Q8NEP7 349 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 CREB3L4Q8TEY5 395 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 UBTD2Q8WUN7 234 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 APH1BQ8WW43 257 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 OSTF1Q92882 214 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 MGAT4CQ9UBM8 478 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 B4GALT6Q9UBX8 382 aa7.29□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 H7C2Y5 167 aa7.28□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 UGDHO60701 494 aa7.28□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 RP2O75695 350 aa7.28□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 ARL6IP5O75915 188 aa7.28□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 OAZ2O95190 189 aa7.28□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 SERPINA3P01011 423 aa7.28□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 ALPPP05187 535 aa7.28□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 CKBP12277 381 aa7.28□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 CD6P30203 668 aa7.28□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 HOXC5Q00444 222 aa7.28□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 ILKQ13418 452 aa7.28□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 COX20Q5RI15 118 aa7.28□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa7.28□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 TMEM145Q8NBT3 493 aa7.28□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 DBF4BQ8NFT6 615 aa7.28□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa7.28□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 ASB12Q8WXK4 309 aa7.28□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 OR5P2Q8WZ92 322 aa7.28□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 RAD9AQ99638 391 aa7.28□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 P2RY12Q9H244 342 aa7.28□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 THSD1Q9NS62 852 aa7.28□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 ACOXLQ9NUZ1 547 aa7.28□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 PTTG3PQ9NZH4 202 aa7.28□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa7.28□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 STC2O76061 302 aa7.28□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 MT-ND5P03915 603 aa7.28□□□□□ -1.24
COL6A4P1-202ENST00000487147 LAMP2P13473 410 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms