RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481807.3

MECP2-208, Transcript of methyl-CpG binding protein 2, human

TSL 3

Gene MECP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MECP2-208	ENST00000481807	SCARB2	Q14108	478 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	SPIDR	Q14159	915 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	MYBPC3	Q14896	1274 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	NDUFA9	Q16795	377 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	TCTE1	Q5JU00	501 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	MED25	Q71SY5	747 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	KMT5C	Q86Y97	462 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	SVOPL	Q8N434	492 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	CEP76	Q8TAP6	659 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	PIGK	Q92643	395 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	TANK	Q92844	425 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	UCN3	Q969E3	161 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	WBP1	Q96G27	269 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	CRELD1	Q96HD1	420 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	MAP3K3	Q99759	626 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807		Q9H521	79 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	IL21R	Q9HBE5	538 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	CAPN10	Q9HC96	672 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	PDE7B	Q9NP56	450 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	PADI4	Q9UM07	663 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	FLNC	Q14315	2725 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	RELN	P78509	3460 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807		A0A087WV62	115 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	GLOD5	A6NK44	160 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	HMGN4	O00479	90 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	EMC8	O43402	210 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	SUV39H1	O43463	412 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	B4GAT1	O43505	415 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	HCRTR1	O43613	425 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	ASNA1	O43681	348 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	HPR	P00739	348 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	ALPPL2	P10696	532 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	CKMT2	P17540	419 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	PPP2R1B	P30154	601 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	KHK	P50053	298 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	CRYBA2	P53672	197 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	RAB38	P57729	211 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	SELENOW	P63302	87 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	FOLH1	Q04609	750 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	BNIP3	Q12983	259 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	GNA13	Q14344	377 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	REEP3	Q6NUK4	255 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	OR4C6	Q8NH72	309 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	SAP25	Q8TEE9	199 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	MAL2	Q969L2	176 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	ELP4	Q96EB1	424 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MECP2-208	ENST00000481807	RDH12	Q96NR8	316 aa		7.48	□□□□□ -1.21

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