RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		10.27	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	LRRK2	Q5S007	2527 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959		H3BQF6	201 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	PEX1	O43933	1283 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	GUCY1B2	O75343	617 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	AGFG2	O95081	481 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	FREM3	P0C091	2139 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF24	P17028	368 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	DDC	P20711	480 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	BGN	P21810	368 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	DNASE1L1	P49184	302 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	CEBPE	Q15744	281 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	CHI3L2	Q15782	390 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	MPEG1	Q2M385	716 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	GALNTL6	Q49A17	601 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	PIGG	Q5H8A4	983 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	FHL5	Q5TD97	284 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	DESI1	Q6ICB0	168 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRR22	Q8IZ63	422 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	KAT2A	Q92830	837 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	GPR137	Q96N19	417 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	SORT1	Q99523	831 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	NIN	Q8N4C6	2090 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	GTF3C1	Q12789	2109 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR6C76	A6NM76	312 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM166B	A8MTA8	275 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	DYRK3	O43781	588 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	HS6ST1	O60243	411 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	SEC22B	O75396	215 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATP6AP2	O75787	350 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	LDLR	P01130	860 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	TUBB	P07437	444 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	FBXO45	P0C2W1	286 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	NEFH	P12036	1026 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	DRD2	P14416	443 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	PIGA	P37287	484 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	C2orf80	Q0P641	193 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAP4K2	Q12851	820 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	BIK	Q13323	160 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	RTL4	Q6ZR62	310 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR2M7	Q8NG81	312 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR7G2	Q8NG99	324 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF675	Q8TD23	568 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	NUDT8	Q8WV74	236 aa		10.25	□□□□□ -0.77

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