RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472943.5

LINC00886-201, long intergenic non-protein coding RNA 886, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00886, Length 3,306 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00886-201ENST00000472943 ZER1Q7Z7L7 766 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 CPXM2Q8N436 756 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 TRAM1L1Q8N609 369 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 UFD1Q92890 307 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 IL21Q9HBE4 155 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 ISYNA1Q9NPH2 558 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 FBXW2Q9UKT8 454 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 LAMA3Q16787 3333 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 WASHC1A8K0Z3 465 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 SLC43A1O75387 559 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 NCR1O76036 304 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 VIPR1P32241 457 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 RAB40BQ12829 278 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 RIN1Q13671 783 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 IL18Q14116 193 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 KIAA1841Q6NSI8 718 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 GDPD4Q6W3E5 623 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 HTR3DQ70Z44 454 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 CMTM8Q8IZV2 173 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 ZFP41Q8N8Y5 198 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF485Q8NCK3 441 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 RNFT2Q96EX2 444 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 FOPNLQ96NB1 174 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 QRFPRQ96P65 431 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 SGPP1Q9BX95 441 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 ABCG4Q9H172 646 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 GALNT9Q9HCQ5 603 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 STMN3Q9NZ72 180 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 CFAP97Q9P2B7 532 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 DYRK1BQ9Y463 629 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 HSPB11Q9Y547 144 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 SCN5AQ14524 2016 aa9.79□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 A0A1W2PRQ8 180 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 SHISA3A0PJX4 238 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 QSOX1O00391 747 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 CASKO14936 926 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 SOD1P00441 154 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 LALBAP00709 142 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 URODP06132 367 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 EPHX1P07099 455 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 LIMS3P0CW19 117 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 LIMS4P0CW20 117 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 SOX18P35713 384 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 COX10Q12887 443 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 DUSP6Q16828 381 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 UAP1L1Q3KQV9 507 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 TPGS2Q68CL5 300 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 KIAA1211LQ6NV74 962 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 TRILQ7L0X0 811 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 CCDC28AQ8IWP9 274 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 TIFAQ96CG3 184 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 HDHD5Q9BXW7 423 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 LRRK1Q38SD2 2015 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 M0R3H8 397 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 ACADMP11310 421 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 MAPK12P53778 367 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 SMIM11AP58511 58 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 PRKCZQ05513 592 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 COL4A6Q14031 1691 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 SNAPC1Q16533 368 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 NXPE4Q6UWF7 544 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 SHFQ7M4L6 423 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 KIF18BQ86Y91 864 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 OR4K5Q8NGD3 323 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 SLC5A11Q8WWX8 675 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 SERHL2Q9H4I8 314 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 SEC14L3Q9UDX4 400 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 SLC23A1Q9UHI7 598 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 CDH10Q9Y6N8 788 aa9.78□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa9.77□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 A0A1W2PQ72 361 aa9.77□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 SGK494L7N484 410 aa9.77□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 PRRG1O14668 218 aa9.77□□□□□ -0.84
LINC00886-201ENST00000472943 PRODHO43272 600 aa9.77□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms