RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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RABGGTB-208ENST00000471759 GCLMP48507 274 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
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RABGGTB-208ENST00000471759 FAM189A2Q15884 450 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.29□□□□□ -1.4
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RABGGTB-208ENST00000471759 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 CDAN1Q8IWY9 1227 aa6.29□□□□□ -1.4
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RABGGTB-208ENST00000471759 SLC34A3Q8N130 599 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 MRGPRDQ8TDS7 321 aa6.29□□□□□ -1.4
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RABGGTB-208ENST00000471759 FCRL4Q96PJ5 515 aa6.29□□□□□ -1.4
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RABGGTB-208ENST00000471759 SLC30A3Q99726 388 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 TXN2Q99757 166 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 IFT27Q9BW83 186 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa6.29□□□□□ -1.4
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RABGGTB-208ENST00000471759 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF225Q9UK10 706 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
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RABGGTB-208ENST00000471759 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
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RABGGTB-208ENST00000471759 SGK494L7N484 410 aa6.28□□□□□ -1.4
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RABGGTB-208ENST00000471759 IGHV2-5P01817 119 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
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RABGGTB-208ENST00000471759 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.45e-6■■■□□ 18.2
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RABGGTB-208ENST00000471759 RIMKLAQ8IXN7 391 aa6.28□□□□□ -1.4
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RABGGTB-208ENST00000471759 OR5M9Q8NGP3 310 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 OR1S1Q8NH92 325 aa6.28□□□□□ -1.4
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RABGGTB-208ENST00000471759 ADAM2Q99965 735 aa6.28□□□□□ -1.4
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RABGGTB-208ENST00000471759 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 OR12D3Q9UGF7 316 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-208ENST00000471759 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
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