RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 ERMP1Q7Z2K6 904 aa8.77□□□□□ -1.01
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SH3BP4-208ENST00000462602 KAT2AQ92830 837 aa8.77□□□□□ -1.01
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SH3BP4-208ENST00000462602 KLK10O43240 276 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
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SH3BP4-208ENST00000462602 HPP00738 406 aa8.75□□□□□ -1.01
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