RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459988.1

UBAP2-208, Transcript of ubiquitin associated protein 2, human

TSL 2

Gene UBAP2, Length 2,628 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBAP2-208	ENST00000459988	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		6.26	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	HM13	Q8TCT9	377 aa		6.26	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		6.26	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	MIEF2	Q96C03	454 aa		6.26	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	C1orf159	Q96HA4	380 aa		6.26	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	COX14	Q96I36	57 aa		6.26	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	OR4K3	Q96R72	315 aa		6.26	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	OR2AG1	Q9H205	316 aa		6.26	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		6.26	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		6.26	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	TMEM160	Q9NX00	188 aa		6.26	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	VAPA	Q9P0L0	249 aa		6.26	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		6.26	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988		A0A096LPI6	279 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	TXNDC9	O14530	226 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	PLAT	P00750	562 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	TPO	P07202	933 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	LINGO3	P0C6S8	592 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	GGT1	P19440	569 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	KLK2	P20151	261 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	FAS	P25445	335 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	GCH1	P30793	250 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	CARD18	P57730	90 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	MTPN	P58546	118 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	HTD2	P86397	168 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	NAE1	Q13564	534 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	DOC2A	Q14183	400 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	CYP51A1	Q16850	503 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	C11orf88	Q6PI97	169 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	CORO6	Q6QEF8	472 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	IFNE	Q86WN2	208 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	KRT73	Q86Y46	540 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	BVES	Q8NE79	360 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	OR2L2	Q8NH16	312 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	MBD6	Q96DN6	1003 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	WDR34	Q96EX3	536 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	APIP	Q96GX9	242 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	ZNF583	Q96ND8	569 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	OR52E6	Q96RD3	313 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	EHD1	Q9H4M9	534 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	SERHL	Q9NQF3	203 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	AURKC	Q9UQB9	309 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988		A0A1W2PR77	199 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	NCK1	P16333	377 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	ACADL	P28330	430 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	S100A3	P33764	101 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	DRD3	P35462	400 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	PITPNB	P48739	271 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	GFRA1	P56159	465 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	PHC1	P78364	1004 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	CDC20	Q12834	499 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	CNTN1	Q12860	1018 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	RPA4	Q13156	261 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	ATG9B	Q674R7	924 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	GLYAT	Q6IB77	296 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	FAM110B	Q8TC76	370 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	STARD8	Q92502	1023 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	ITCH	Q96J02	903 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	CIB1	Q99828	191 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	RMND5A	Q9H871	391 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	USP22	Q9UPT9	525 aa		6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	C7orf72	A4D263	438 aa		6.24	□□□□□ -1.41
UBAP2-208	ENST00000459988	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41

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