RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 KRT73Q86Y46 540 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 CLIP4Q8N3C7 705 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 OR52E1Q8NGJ3 308 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM80Q96HE8 168 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 SP140LQ9H930 580 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 ATG4BQ9Y4P1 393 aa15.11■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 OR52A4PA6NMU1 304 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 LGI1O95970 557 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 C5AR1P21730 350 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 MMP11P24347 488 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 PPP2R1BP30154 601 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 S100A5P33763 92 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 KHKP50053 298 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF91Q05481 1191 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 GPM6BQ13491 265 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 OCLNQ16625 522 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF750Q32MQ0 723 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 TCEANCQ8N8B7 351 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 OR6T1Q8NGN1 323 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 OR8K5Q8NH50 307 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 BBS10Q8TAM1 723 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 FAM210AQ96ND0 272 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 SYNPO2LQ9H987 977 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 SFXN1Q9H9B4 322 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 MKLN1Q9UL63 735 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 PEX16Q9Y5Y5 336 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 NUMA1Q14980 2115 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 NINQ8N4C6 2090 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 HAT1O14929 419 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 ERI3O43414 337 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 CSO75390 466 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 NME6O75414 186 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 DNTTP04053 509 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 CKMT1AP12532 417 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 NTSP30990 170 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 ETV6P41212 452 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 MAN2A2P49641 1150 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 FBXL6Q8N531 539 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 ACOT4Q8N9L9 421 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 MORN4Q8NDC4 146 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 BBS4Q96RK4 519 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 GPA33Q99795 319 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 TPST2O60704 377 aa15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 ADH1BP00325 375 aa15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 ALPPL2P10696 532 aa15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 TNNI3P19429 210 aa15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 MAGEA8P43361 318 aa15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 PRKAG1P54619 331 aa15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 COX10Q12887 443 aa15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 RNLSQ5VYX0 342 aa15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 HMGN2P46Q86SG4 172 aa15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 IQCF1Q8N6M8 205 aa15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 IL17RCQ8NAC3 791 aa15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 OR4K5Q8NGD3 323 aa15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 YIPF4Q9BSR8 244 aa15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 CPNE5Q9HCH3 593 aa15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 CES1P1Q9UKY3 287 aa15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 CFL2Q9Y281 166 aa15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 DOCK9Q9BZ29 2069 aa15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 AQP9O43315 295 aa15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 DUSP6Q16828 381 aa15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC116Q8IYX3 515 aa15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 SFXN5Q8TD22 340 aa15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 FGF11Q92914 225 aa15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 FNDC11Q9BVV2 318 aa15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 SARGQ9BW04 601 aa15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 TSSK6Q9BXA6 273 aa15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa15.09■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 A0A1W2PS29 197 aa15.08■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 GRXCR1A8MXD5 290 aa15.08■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 PRKYO43930 277 aa15.08■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 CA3P07451 260 aa15.08■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 HBQ1P09105 142 aa15.08■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 EFNB1P98172 346 aa15.08■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 SPHARQ15513 63 aa15.08■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 C1orf94Q6P1W5 598 aa15.08■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 SLC34A3Q8N130 599 aa15.08■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 FAM26EQ8N5C1 309 aa15.08■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 NANOGP1Q8N7R0 232 aa15.08■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 OR2L3Q8NG85 312 aa15.08■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa15.08■□□□□ 0.01
SHQ1-202ENST00000444040 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms