RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441703.5

HDAC6-210, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC6, Length 599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-210ENST00000441703 PRPSAP2O60256 369 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 DLX3O60479 287 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 PRAMEF2O60811 474 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 MFN2O95140 757 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 PGLSO95336 258 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 MLYCDO95822 493 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 HTR1AP08908 422 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 HBQ1P09105 142 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 SPNP16150 400 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF30P17039 623 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 GPD1P21695 349 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 GPX3P22352 226 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 ENPP1P22413 925 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 MGAT1P26572 445 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 MST1P26927 711 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 SLC19A1P41440 591 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 HTR3AP46098 478 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 ARSFP54793 590 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 NAGLUP54802 743 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 AIF1P55008 147 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 OR2B6P58173 313 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 CXCR4P61073 352 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 PPP1CAP62136 330 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 ABRQ12979 859 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 MFAP5Q13361 173 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 IKZF1Q13422 519 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 GPR18Q14330 331 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 DPY19L1Q2PZI1 675 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 SMU1Q2TAY7 513 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 ZFP69Q49AA0 526 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 ESCO2Q56NI9 601 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 STEAP3Q658P3 488 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 ARMC6Q6NXE6 501 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 RFLNAQ6ZTI6 216 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 PLCZ1Q86YW0 608 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 CCDC103Q8IW40 242 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 METTL4Q8N3J2 472 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 OR2Y1Q8NGV0 311 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 MCFD2Q8NI22 146 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 PSMA8Q8TAA3 256 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 SUN3Q8TAQ9 357 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 HTRA1Q92743 480 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 RORBQ92753 470 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 SCAMP4Q969E2 229 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 PTERQ96BW5 349 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 MBD6Q96DN6 1003 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 CCDC126Q96EE4 140 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 RNF170Q96K19 258 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 MARK4Q96L34 752 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 SPATA13Q96N96 652 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 PEBP4Q96S96 227 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 AGAP2Q99490 1192 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 GPR22Q99680 433 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 TRIM54Q9BYV2 358 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 SLC39A8Q9C0K1 460 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 LIME1Q9H400 295 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 ABCB10Q9NRK6 738 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 TMEM45AQ9NWC5 275 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 FAM118AQ9NWS6 357 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 CMTM6Q9NX76 183 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 OPTCQ9UBM4 332 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 FBXL4Q9UKA2 621 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 MKLN1Q9UL63 735 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 TRAPPC4Q9Y296 219 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 PPIL1Q9Y3C6 166 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC6-210ENST00000441703 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 CCDC154A6NI56 674 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 GPR89AB7ZAQ6 455 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 TMEM150CB9EJG8 249 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 E7EQ34 232 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 UPK1AO00322 258 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 SLC16A6O15403 523 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 ARHGEF9O43307 516 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 ALOX12BO75342 701 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 UGT2B17O75795 530 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
HDAC6-210ENST00000441703 TSPAN9O75954 239 aa6.08□□□□□ -1.44
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